Protein–RNA interactions for Protein: Q96QE5

TEFM, Transcription elongation factor, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TEFMQ96QE5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TEFMQ96QE5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TEFMQ96QE5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TEFMQ96QE5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TEFMQ96QE5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TEFMQ96QE5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TEFMQ96QE5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TEFMQ96QE5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TEFMQ96QE5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TEFMQ96QE5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TEFMQ96QE5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TEFMQ96QE5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TEFMQ96QE5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TEFMQ96QE5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TEFMQ96QE5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TEFMQ96QE5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TEFMQ96QE5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TEFMQ96QE5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TEFMQ96QE5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TEFMQ96QE5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TEFMQ96QE5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TEFMQ96QE5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TEFMQ96QE5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TEFMQ96QE5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TEFMQ96QE5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TEFMQ96QE5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TEFMQ96QE5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TEFMQ96QE5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TEFMQ96QE5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TEFMQ96QE5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TEFMQ96QE5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TEFMQ96QE5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TEFMQ96QE5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TEFMQ96QE5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TEFMQ96QE5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TEFMQ96QE5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TEFMQ96QE5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TEFMQ96QE5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TEFMQ96QE5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TEFMQ96QE5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TEFMQ96QE5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TEFMQ96QE5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TEFMQ96QE5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TEFMQ96QE5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TEFMQ96QE5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TEFMQ96QE5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TEFMQ96QE5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TEFMQ96QE5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TEFMQ96QE5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TEFMQ96QE5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TEFMQ96QE5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TEFMQ96QE5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TEFMQ96QE5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TEFMQ96QE5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TEFMQ96QE5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TEFMQ96QE5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TEFMQ96QE5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TEFMQ96QE5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TEFMQ96QE5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TEFMQ96QE5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TEFMQ96QE5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TEFMQ96QE5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TEFMQ96QE5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TEFMQ96QE5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TEFMQ96QE5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TEFMQ96QE5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TEFMQ96QE5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TEFMQ96QE5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TEFMQ96QE5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TEFMQ96QE5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TEFMQ96QE5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TEFMQ96QE5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TEFMQ96QE5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TEFMQ96QE5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TEFMQ96QE5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TEFMQ96QE5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TEFMQ96QE5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TEFMQ96QE5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TEFMQ96QE5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TEFMQ96QE5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TEFMQ96QE5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TEFMQ96QE5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TEFMQ96QE5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TEFMQ96QE5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TEFMQ96QE5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TEFMQ96QE5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TEFMQ96QE5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TEFMQ96QE5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TEFMQ96QE5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TEFMQ96QE5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TEFMQ96QE5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TEFMQ96QE5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TEFMQ96QE5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TEFMQ96QE5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TEFMQ96QE5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TEFMQ96QE5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TEFMQ96QE5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TEFMQ96QE5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TEFMQ96QE5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TEFMQ96QE5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms