Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
GBP4Q96PP9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
GBP4Q96PP9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
GBP4Q96PP9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
GBP4Q96PP9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
GBP4Q96PP9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
GBP4Q96PP9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
GBP4Q96PP9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
GBP4Q96PP9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
GBP4Q96PP9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
GBP4Q96PP9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
GBP4Q96PP9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
GBP4Q96PP9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
GBP4Q96PP9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
GBP4Q96PP9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
GBP4Q96PP9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
GBP4Q96PP9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
GBP4Q96PP9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
GBP4Q96PP9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
GBP4Q96PP9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
GBP4Q96PP9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
GBP4Q96PP9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
GBP4Q96PP9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
GBP4Q96PP9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
GBP4Q96PP9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
GBP4Q96PP9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
GBP4Q96PP9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
GBP4Q96PP9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
GBP4Q96PP9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
GBP4Q96PP9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
GBP4Q96PP9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
GBP4Q96PP9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
GBP4Q96PP9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
GBP4Q96PP9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
GBP4Q96PP9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
GBP4Q96PP9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
GBP4Q96PP9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
GBP4Q96PP9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
GBP4Q96PP9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
GBP4Q96PP9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
GBP4Q96PP9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
GBP4Q96PP9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
GBP4Q96PP9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
GBP4Q96PP9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
GBP4Q96PP9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
GBP4Q96PP9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
GBP4Q96PP9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
GBP4Q96PP9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
GBP4Q96PP9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
GBP4Q96PP9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
GBP4Q96PP9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
GBP4Q96PP9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
GBP4Q96PP9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
GBP4Q96PP9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
GBP4Q96PP9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
GBP4Q96PP9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
GBP4Q96PP9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
GBP4Q96PP9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
GBP4Q96PP9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
GBP4Q96PP9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
GBP4Q96PP9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
GBP4Q96PP9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
GBP4Q96PP9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
GBP4Q96PP9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
GBP4Q96PP9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
GBP4Q96PP9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
GBP4Q96PP9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
GBP4Q96PP9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
GBP4Q96PP9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
GBP4Q96PP9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
GBP4Q96PP9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
GBP4Q96PP9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
GBP4Q96PP9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
GBP4Q96PP9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
GBP4Q96PP9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
GBP4Q96PP9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
GBP4Q96PP9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
GBP4Q96PP9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
GBP4Q96PP9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
GBP4Q96PP9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
GBP4Q96PP9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
GBP4Q96PP9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
GBP4Q96PP9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
GBP4Q96PP9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
GBP4Q96PP9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
GBP4Q96PP9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
GBP4Q96PP9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
GBP4Q96PP9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
GBP4Q96PP9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GBP4Q96PP9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GBP4Q96PP9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
GBP4Q96PP9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GBP4Q96PP9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GBP4Q96PP9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GBP4Q96PP9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GBP4Q96PP9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
GBP4Q96PP9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
GBP4Q96PP9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
GBP4Q96PP9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
GBP4Q96PP9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms