Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC43.12■■■■■ 4.49
CTTNBP2Q8WZ74 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC43.11■■■■■ 4.49
CTTNBP2Q8WZ74 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.11■■■■■ 4.49
CTTNBP2Q8WZ74 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC43.11■■■■■ 4.49
CTTNBP2Q8WZ74 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
CTTNBP2Q8WZ74 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
CTTNBP2Q8WZ74 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
CTTNBP2Q8WZ74 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC43.08■■■■■ 4.49
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC43.08■■■■■ 4.49
CTTNBP2Q8WZ74 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC43.06■■■■■ 4.48
CTTNBP2Q8WZ74 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC43.05■■■■■ 4.48
CTTNBP2Q8WZ74 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC43.04■■■■■ 4.48
CTTNBP2Q8WZ74 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
CTTNBP2Q8WZ74 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC43.02■■■■■ 4.48
CTTNBP2Q8WZ74 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
CTTNBP2Q8WZ74 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
CTTNBP2Q8WZ74 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
CTTNBP2Q8WZ74 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC42.99■■■■■ 4.47
CTTNBP2Q8WZ74 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC42.95■■■■■ 4.47
CTTNBP2Q8WZ74 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC42.95■■■■■ 4.47
CTTNBP2Q8WZ74 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC42.95■■■■■ 4.47
CTTNBP2Q8WZ74 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC42.95■■■■■ 4.47
CTTNBP2Q8WZ74 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC42.95■■■■■ 4.47
CTTNBP2Q8WZ74 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC42.95■■■■■ 4.47
CTTNBP2Q8WZ74 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC42.95■■■■■ 4.47
CTTNBP2Q8WZ74 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC42.95■■■■■ 4.47
CTTNBP2Q8WZ74 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC42.95■■■■■ 4.47
CTTNBP2Q8WZ74 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
CTTNBP2Q8WZ74 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
CTTNBP2Q8WZ74 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC42.93■■■■■ 4.46
CTTNBP2Q8WZ74 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
CTTNBP2Q8WZ74 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
CTTNBP2Q8WZ74 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC42.89■■■■■ 4.46
CTTNBP2Q8WZ74 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC42.89■■■■■ 4.46
CTTNBP2Q8WZ74 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.89■■■■■ 4.46
CTTNBP2Q8WZ74 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.88■■■■■ 4.45
CTTNBP2Q8WZ74 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
CTTNBP2Q8WZ74 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
CTTNBP2Q8WZ74 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC42.86■■■■■ 4.45
CTTNBP2Q8WZ74 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
CTTNBP2Q8WZ74 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
CTTNBP2Q8WZ74 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
CTTNBP2Q8WZ74 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
CTTNBP2Q8WZ74 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC42.83■■■■■ 4.45
CTTNBP2Q8WZ74 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC42.82■■■■■ 4.44
CTTNBP2Q8WZ74 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC42.81■■■■■ 4.44
CTTNBP2Q8WZ74 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
CTTNBP2Q8WZ74 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.8■■■■■ 4.44
CTTNBP2Q8WZ74 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC42.8■■■■■ 4.44
CTTNBP2Q8WZ74 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
CTTNBP2Q8WZ74 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC42.79■■■■■ 4.44
CTTNBP2Q8WZ74 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
CTTNBP2Q8WZ74 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
CTTNBP2Q8WZ74 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
CTTNBP2Q8WZ74 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC42.76■■■■■ 4.44
CTTNBP2Q8WZ74 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC42.76■■■■■ 4.44
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC42.76■■■■■ 4.44
CTTNBP2Q8WZ74 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC42.75■■■■■ 4.43
CTTNBP2Q8WZ74 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
CTTNBP2Q8WZ74 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC42.74■■■■■ 4.43
CTTNBP2Q8WZ74 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
CTTNBP2Q8WZ74 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
CTTNBP2Q8WZ74 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
CTTNBP2Q8WZ74 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
CTTNBP2Q8WZ74 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.71■■■■■ 4.43
CTTNBP2Q8WZ74 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC42.7■■■■■ 4.43
CTTNBP2Q8WZ74 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
CTTNBP2Q8WZ74 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
CTTNBP2Q8WZ74 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC42.68■■■■■ 4.42
CTTNBP2Q8WZ74 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC42.67■■■■■ 4.42
CTTNBP2Q8WZ74 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
CTTNBP2Q8WZ74 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.66■■■■■ 4.42
CTTNBP2Q8WZ74 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC42.65■■■■■ 4.42
CTTNBP2Q8WZ74 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
CTTNBP2Q8WZ74 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
CTTNBP2Q8WZ74 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC42.64■■■■■ 4.42
CTTNBP2Q8WZ74 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
CTTNBP2Q8WZ74 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC42.63■■■■■ 4.42
CTTNBP2Q8WZ74 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC42.63■■■■■ 4.41
CTTNBP2Q8WZ74 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
CTTNBP2Q8WZ74 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
CTTNBP2Q8WZ74 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.62■■■■■ 4.41
CTTNBP2Q8WZ74 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.62■■■■■ 4.41
CTTNBP2Q8WZ74 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC42.61■■■■■ 4.41
CTTNBP2Q8WZ74 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
CTTNBP2Q8WZ74 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
CTTNBP2Q8WZ74 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC42.59■■■■■ 4.41
CTTNBP2Q8WZ74 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.4
CTTNBP2Q8WZ74 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC42.57■■■■■ 4.4
CTTNBP2Q8WZ74 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
CTTNBP2Q8WZ74 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
CTTNBP2Q8WZ74 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
CTTNBP2Q8WZ74 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
CTTNBP2Q8WZ74 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
CTTNBP2Q8WZ74 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC42.52■■■■■ 4.4
CTTNBP2Q8WZ74 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC42.52■■■■■ 4.4
CTTNBP2Q8WZ74 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
CTTNBP2Q8WZ74 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC42.51■■■■■ 4.39
CTTNBP2Q8WZ74 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
CTTNBP2Q8WZ74 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms