Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATRIPQ8WXE1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATRIPQ8WXE1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATRIPQ8WXE1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATRIPQ8WXE1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATRIPQ8WXE1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATRIPQ8WXE1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATRIPQ8WXE1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATRIPQ8WXE1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATRIPQ8WXE1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATRIPQ8WXE1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATRIPQ8WXE1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
ATRIPQ8WXE1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATRIPQ8WXE1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATRIPQ8WXE1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATRIPQ8WXE1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
ATRIPQ8WXE1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATRIPQ8WXE1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
ATRIPQ8WXE1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATRIPQ8WXE1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATRIPQ8WXE1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATRIPQ8WXE1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATRIPQ8WXE1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
ATRIPQ8WXE1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATRIPQ8WXE1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATRIPQ8WXE1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATRIPQ8WXE1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATRIPQ8WXE1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATRIPQ8WXE1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATRIPQ8WXE1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATRIPQ8WXE1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATRIPQ8WXE1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATRIPQ8WXE1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATRIPQ8WXE1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
ATRIPQ8WXE1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATRIPQ8WXE1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATRIPQ8WXE1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATRIPQ8WXE1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATRIPQ8WXE1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATRIPQ8WXE1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATRIPQ8WXE1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATRIPQ8WXE1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATRIPQ8WXE1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATRIPQ8WXE1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATRIPQ8WXE1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATRIPQ8WXE1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATRIPQ8WXE1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATRIPQ8WXE1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATRIPQ8WXE1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATRIPQ8WXE1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ATRIPQ8WXE1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATRIPQ8WXE1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATRIPQ8WXE1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATRIPQ8WXE1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATRIPQ8WXE1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATRIPQ8WXE1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATRIPQ8WXE1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATRIPQ8WXE1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATRIPQ8WXE1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATRIPQ8WXE1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATRIPQ8WXE1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATRIPQ8WXE1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATRIPQ8WXE1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATRIPQ8WXE1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATRIPQ8WXE1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ATRIPQ8WXE1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATRIPQ8WXE1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATRIPQ8WXE1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
ATRIPQ8WXE1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATRIPQ8WXE1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATRIPQ8WXE1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATRIPQ8WXE1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATRIPQ8WXE1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
ATRIPQ8WXE1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATRIPQ8WXE1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATRIPQ8WXE1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ATRIPQ8WXE1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATRIPQ8WXE1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATRIPQ8WXE1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATRIPQ8WXE1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATRIPQ8WXE1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ATRIPQ8WXE1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ATRIPQ8WXE1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ATRIPQ8WXE1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ATRIPQ8WXE1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATRIPQ8WXE1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATRIPQ8WXE1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATRIPQ8WXE1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATRIPQ8WXE1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATRIPQ8WXE1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATRIPQ8WXE1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ATRIPQ8WXE1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ATRIPQ8WXE1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATRIPQ8WXE1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATRIPQ8WXE1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATRIPQ8WXE1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATRIPQ8WXE1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATRIPQ8WXE1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATRIPQ8WXE1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATRIPQ8WXE1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.3 ms