Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVK2

SNRNP27, U4/U6.U5 small nuclear ribonucleoprotein 27 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP27Q8WVK2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNRNP27Q8WVK2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNRNP27Q8WVK2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNRNP27Q8WVK2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNRNP27Q8WVK2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNRNP27Q8WVK2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNRNP27Q8WVK2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNRNP27Q8WVK2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNRNP27Q8WVK2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNRNP27Q8WVK2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNRNP27Q8WVK2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNRNP27Q8WVK2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SNRNP27Q8WVK2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNRNP27Q8WVK2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNRNP27Q8WVK2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNRNP27Q8WVK2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNRNP27Q8WVK2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SNRNP27Q8WVK2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SNRNP27Q8WVK2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SNRNP27Q8WVK2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SNRNP27Q8WVK2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SNRNP27Q8WVK2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SNRNP27Q8WVK2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNRNP27Q8WVK2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNRNP27Q8WVK2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNRNP27Q8WVK2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNRNP27Q8WVK2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNRNP27Q8WVK2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SNRNP27Q8WVK2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNRNP27Q8WVK2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNRNP27Q8WVK2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNRNP27Q8WVK2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNRNP27Q8WVK2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNRNP27Q8WVK2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNRNP27Q8WVK2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNRNP27Q8WVK2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNRNP27Q8WVK2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNRNP27Q8WVK2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNRNP27Q8WVK2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNRNP27Q8WVK2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNRNP27Q8WVK2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNRNP27Q8WVK2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNRNP27Q8WVK2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SNRNP27Q8WVK2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNRNP27Q8WVK2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNRNP27Q8WVK2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNRNP27Q8WVK2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNRNP27Q8WVK2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNRNP27Q8WVK2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNRNP27Q8WVK2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNRNP27Q8WVK2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNRNP27Q8WVK2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNRNP27Q8WVK2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNRNP27Q8WVK2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNRNP27Q8WVK2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNRNP27Q8WVK2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNRNP27Q8WVK2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNRNP27Q8WVK2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNRNP27Q8WVK2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNRNP27Q8WVK2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNRNP27Q8WVK2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SNRNP27Q8WVK2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNRNP27Q8WVK2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNRNP27Q8WVK2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNRNP27Q8WVK2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNRNP27Q8WVK2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNRNP27Q8WVK2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNRNP27Q8WVK2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNRNP27Q8WVK2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNRNP27Q8WVK2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNRNP27Q8WVK2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNRNP27Q8WVK2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNRNP27Q8WVK2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNRNP27Q8WVK2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNRNP27Q8WVK2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNRNP27Q8WVK2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNRNP27Q8WVK2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNRNP27Q8WVK2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SNRNP27Q8WVK2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNRNP27Q8WVK2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNRNP27Q8WVK2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNRNP27Q8WVK2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNRNP27Q8WVK2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNRNP27Q8WVK2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNRNP27Q8WVK2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNRNP27Q8WVK2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNRNP27Q8WVK2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNRNP27Q8WVK2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNRNP27Q8WVK2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNRNP27Q8WVK2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNRNP27Q8WVK2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNRNP27Q8WVK2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNRNP27Q8WVK2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNRNP27Q8WVK2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNRNP27Q8WVK2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNRNP27Q8WVK2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNRNP27Q8WVK2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNRNP27Q8WVK2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNRNP27Q8WVK2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNRNP27Q8WVK2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms