Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTV0

SCARB1, Scavenger receptor class B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB1Q8WTV0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SCARB1Q8WTV0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCARB1Q8WTV0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCARB1Q8WTV0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCARB1Q8WTV0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCARB1Q8WTV0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCARB1Q8WTV0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCARB1Q8WTV0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCARB1Q8WTV0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCARB1Q8WTV0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCARB1Q8WTV0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCARB1Q8WTV0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCARB1Q8WTV0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCARB1Q8WTV0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCARB1Q8WTV0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCARB1Q8WTV0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCARB1Q8WTV0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCARB1Q8WTV0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCARB1Q8WTV0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCARB1Q8WTV0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCARB1Q8WTV0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCARB1Q8WTV0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCARB1Q8WTV0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCARB1Q8WTV0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCARB1Q8WTV0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCARB1Q8WTV0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCARB1Q8WTV0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SCARB1Q8WTV0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCARB1Q8WTV0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCARB1Q8WTV0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCARB1Q8WTV0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCARB1Q8WTV0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCARB1Q8WTV0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCARB1Q8WTV0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCARB1Q8WTV0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCARB1Q8WTV0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCARB1Q8WTV0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCARB1Q8WTV0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCARB1Q8WTV0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCARB1Q8WTV0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCARB1Q8WTV0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCARB1Q8WTV0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SCARB1Q8WTV0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCARB1Q8WTV0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCARB1Q8WTV0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCARB1Q8WTV0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCARB1Q8WTV0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCARB1Q8WTV0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCARB1Q8WTV0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCARB1Q8WTV0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCARB1Q8WTV0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCARB1Q8WTV0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCARB1Q8WTV0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCARB1Q8WTV0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCARB1Q8WTV0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCARB1Q8WTV0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCARB1Q8WTV0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCARB1Q8WTV0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCARB1Q8WTV0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCARB1Q8WTV0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCARB1Q8WTV0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCARB1Q8WTV0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCARB1Q8WTV0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCARB1Q8WTV0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCARB1Q8WTV0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCARB1Q8WTV0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCARB1Q8WTV0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCARB1Q8WTV0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCARB1Q8WTV0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARB1Q8WTV0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARB1Q8WTV0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARB1Q8WTV0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARB1Q8WTV0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARB1Q8WTV0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARB1Q8WTV0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARB1Q8WTV0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARB1Q8WTV0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCARB1Q8WTV0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCARB1Q8WTV0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCARB1Q8WTV0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCARB1Q8WTV0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCARB1Q8WTV0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCARB1Q8WTV0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCARB1Q8WTV0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCARB1Q8WTV0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARB1Q8WTV0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARB1Q8WTV0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARB1Q8WTV0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SCARB1Q8WTV0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCARB1Q8WTV0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCARB1Q8WTV0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCARB1Q8WTV0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCARB1Q8WTV0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCARB1Q8WTV0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARB1Q8WTV0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARB1Q8WTV0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARB1Q8WTV0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARB1Q8WTV0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARB1Q8WTV0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCARB1Q8WTV0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms