Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDN6

BRIX1, Ribosome biogenesis protein BRX1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIX1Q8TDN6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
BRIX1Q8TDN6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
BRIX1Q8TDN6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
BRIX1Q8TDN6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRIX1Q8TDN6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRIX1Q8TDN6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRIX1Q8TDN6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRIX1Q8TDN6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRIX1Q8TDN6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRIX1Q8TDN6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRIX1Q8TDN6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
BRIX1Q8TDN6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRIX1Q8TDN6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
BRIX1Q8TDN6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
BRIX1Q8TDN6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRIX1Q8TDN6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRIX1Q8TDN6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRIX1Q8TDN6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRIX1Q8TDN6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRIX1Q8TDN6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
BRIX1Q8TDN6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRIX1Q8TDN6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRIX1Q8TDN6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRIX1Q8TDN6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRIX1Q8TDN6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRIX1Q8TDN6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRIX1Q8TDN6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRIX1Q8TDN6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRIX1Q8TDN6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRIX1Q8TDN6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRIX1Q8TDN6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRIX1Q8TDN6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRIX1Q8TDN6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRIX1Q8TDN6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRIX1Q8TDN6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRIX1Q8TDN6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRIX1Q8TDN6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRIX1Q8TDN6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRIX1Q8TDN6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRIX1Q8TDN6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRIX1Q8TDN6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRIX1Q8TDN6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRIX1Q8TDN6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
BRIX1Q8TDN6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRIX1Q8TDN6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRIX1Q8TDN6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
BRIX1Q8TDN6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRIX1Q8TDN6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRIX1Q8TDN6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRIX1Q8TDN6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRIX1Q8TDN6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRIX1Q8TDN6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRIX1Q8TDN6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRIX1Q8TDN6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRIX1Q8TDN6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRIX1Q8TDN6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRIX1Q8TDN6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRIX1Q8TDN6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRIX1Q8TDN6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRIX1Q8TDN6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRIX1Q8TDN6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRIX1Q8TDN6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRIX1Q8TDN6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRIX1Q8TDN6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRIX1Q8TDN6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRIX1Q8TDN6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRIX1Q8TDN6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRIX1Q8TDN6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRIX1Q8TDN6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRIX1Q8TDN6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRIX1Q8TDN6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRIX1Q8TDN6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRIX1Q8TDN6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRIX1Q8TDN6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRIX1Q8TDN6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRIX1Q8TDN6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRIX1Q8TDN6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRIX1Q8TDN6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRIX1Q8TDN6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRIX1Q8TDN6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
BRIX1Q8TDN6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRIX1Q8TDN6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRIX1Q8TDN6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRIX1Q8TDN6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRIX1Q8TDN6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRIX1Q8TDN6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRIX1Q8TDN6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRIX1Q8TDN6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRIX1Q8TDN6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRIX1Q8TDN6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRIX1Q8TDN6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRIX1Q8TDN6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRIX1Q8TDN6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRIX1Q8TDN6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRIX1Q8TDN6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRIX1Q8TDN6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRIX1Q8TDN6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRIX1Q8TDN6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRIX1Q8TDN6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRIX1Q8TDN6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms