Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDX1

PSD4, PH and SEC7 domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,056 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD4Q8NDX1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSD4Q8NDX1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSD4Q8NDX1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSD4Q8NDX1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSD4Q8NDX1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSD4Q8NDX1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSD4Q8NDX1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSD4Q8NDX1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSD4Q8NDX1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSD4Q8NDX1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PSD4Q8NDX1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSD4Q8NDX1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSD4Q8NDX1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSD4Q8NDX1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSD4Q8NDX1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSD4Q8NDX1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSD4Q8NDX1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSD4Q8NDX1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PSD4Q8NDX1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSD4Q8NDX1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSD4Q8NDX1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSD4Q8NDX1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSD4Q8NDX1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSD4Q8NDX1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSD4Q8NDX1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSD4Q8NDX1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSD4Q8NDX1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSD4Q8NDX1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSD4Q8NDX1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSD4Q8NDX1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSD4Q8NDX1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSD4Q8NDX1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSD4Q8NDX1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSD4Q8NDX1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSD4Q8NDX1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSD4Q8NDX1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PSD4Q8NDX1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSD4Q8NDX1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSD4Q8NDX1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSD4Q8NDX1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSD4Q8NDX1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSD4Q8NDX1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSD4Q8NDX1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSD4Q8NDX1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PSD4Q8NDX1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSD4Q8NDX1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSD4Q8NDX1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSD4Q8NDX1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSD4Q8NDX1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSD4Q8NDX1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSD4Q8NDX1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSD4Q8NDX1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSD4Q8NDX1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSD4Q8NDX1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSD4Q8NDX1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSD4Q8NDX1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSD4Q8NDX1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSD4Q8NDX1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSD4Q8NDX1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSD4Q8NDX1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PSD4Q8NDX1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSD4Q8NDX1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSD4Q8NDX1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSD4Q8NDX1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSD4Q8NDX1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSD4Q8NDX1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSD4Q8NDX1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSD4Q8NDX1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSD4Q8NDX1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSD4Q8NDX1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSD4Q8NDX1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSD4Q8NDX1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSD4Q8NDX1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSD4Q8NDX1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSD4Q8NDX1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSD4Q8NDX1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSD4Q8NDX1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSD4Q8NDX1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSD4Q8NDX1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSD4Q8NDX1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PSD4Q8NDX1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSD4Q8NDX1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSD4Q8NDX1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSD4Q8NDX1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSD4Q8NDX1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSD4Q8NDX1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PSD4Q8NDX1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSD4Q8NDX1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PSD4Q8NDX1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSD4Q8NDX1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSD4Q8NDX1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSD4Q8NDX1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSD4Q8NDX1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSD4Q8NDX1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSD4Q8NDX1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSD4Q8NDX1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSD4Q8NDX1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSD4Q8NDX1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSD4Q8NDX1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSD4Q8NDX1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms