Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB14

USP38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP38Q8NB14 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP38Q8NB14 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
USP38Q8NB14 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP38Q8NB14 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP38Q8NB14 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
USP38Q8NB14 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP38Q8NB14 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP38Q8NB14 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP38Q8NB14 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP38Q8NB14 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP38Q8NB14 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP38Q8NB14 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP38Q8NB14 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP38Q8NB14 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP38Q8NB14 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP38Q8NB14 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
USP38Q8NB14 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP38Q8NB14 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP38Q8NB14 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP38Q8NB14 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP38Q8NB14 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP38Q8NB14 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP38Q8NB14 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP38Q8NB14 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP38Q8NB14 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP38Q8NB14 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP38Q8NB14 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP38Q8NB14 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP38Q8NB14 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP38Q8NB14 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP38Q8NB14 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP38Q8NB14 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP38Q8NB14 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
USP38Q8NB14 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP38Q8NB14 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP38Q8NB14 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP38Q8NB14 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP38Q8NB14 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP38Q8NB14 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP38Q8NB14 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP38Q8NB14 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
USP38Q8NB14 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP38Q8NB14 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP38Q8NB14 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP38Q8NB14 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP38Q8NB14 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP38Q8NB14 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP38Q8NB14 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP38Q8NB14 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP38Q8NB14 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
USP38Q8NB14 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
USP38Q8NB14 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP38Q8NB14 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP38Q8NB14 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP38Q8NB14 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP38Q8NB14 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
USP38Q8NB14 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP38Q8NB14 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP38Q8NB14 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP38Q8NB14 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP38Q8NB14 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP38Q8NB14 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP38Q8NB14 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP38Q8NB14 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP38Q8NB14 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP38Q8NB14 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
USP38Q8NB14 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
USP38Q8NB14 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
USP38Q8NB14 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP38Q8NB14 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP38Q8NB14 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP38Q8NB14 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP38Q8NB14 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
USP38Q8NB14 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
USP38Q8NB14 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
USP38Q8NB14 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP38Q8NB14 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP38Q8NB14 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP38Q8NB14 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP38Q8NB14 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP38Q8NB14 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP38Q8NB14 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP38Q8NB14 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP38Q8NB14 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP38Q8NB14 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP38Q8NB14 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP38Q8NB14 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP38Q8NB14 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP38Q8NB14 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP38Q8NB14 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP38Q8NB14 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP38Q8NB14 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP38Q8NB14 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP38Q8NB14 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP38Q8NB14 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP38Q8NB14 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP38Q8NB14 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP38Q8NB14 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP38Q8NB14 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP38Q8NB14 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms