Protein–RNA interactions for Protein: Q8N402

Putative uncharacterized protein LOC388882, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8N402 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q8N402 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Q8N402 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q8N402 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Q8N402 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q8N402 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q8N402 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q8N402 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q8N402 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q8N402 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q8N402 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q8N402 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q8N402 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q8N402 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q8N402 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q8N402 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q8N402 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q8N402 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q8N402 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q8N402 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q8N402 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q8N402 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q8N402 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q8N402 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Q8N402 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q8N402 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q8N402 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q8N402 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q8N402 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q8N402 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q8N402 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q8N402 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q8N402 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q8N402 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q8N402 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q8N402 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q8N402 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q8N402 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q8N402 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q8N402 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q8N402 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q8N402 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q8N402 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q8N402 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q8N402 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q8N402 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q8N402 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q8N402 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q8N402 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q8N402 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q8N402 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q8N402 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q8N402 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q8N402 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q8N402 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Q8N402 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q8N402 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q8N402 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q8N402 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q8N402 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Q8N402 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q8N402 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q8N402 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q8N402 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q8N402 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q8N402 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q8N402 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q8N402 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q8N402 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q8N402 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q8N402 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q8N402 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q8N402 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q8N402 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Q8N402 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q8N402 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q8N402 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q8N402 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q8N402 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q8N402 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q8N402 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q8N402 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q8N402 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q8N402 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q8N402 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q8N402 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q8N402 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q8N402 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Q8N402 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q8N402 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q8N402 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q8N402 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q8N402 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q8N402 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q8N402 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q8N402 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q8N402 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q8N402 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q8N402 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q8N402 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms