Protein–RNA interactions for Protein: Q8N370

SLC43A2, Large neutral amino acids transporter small subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC43A2Q8N370 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC43A2Q8N370 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC43A2Q8N370 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC43A2Q8N370 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC43A2Q8N370 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC43A2Q8N370 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC43A2Q8N370 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC43A2Q8N370 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC43A2Q8N370 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC43A2Q8N370 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC43A2Q8N370 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC43A2Q8N370 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC43A2Q8N370 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC43A2Q8N370 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC43A2Q8N370 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC43A2Q8N370 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC43A2Q8N370 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC43A2Q8N370 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC43A2Q8N370 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC43A2Q8N370 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC43A2Q8N370 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC43A2Q8N370 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC43A2Q8N370 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC43A2Q8N370 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC43A2Q8N370 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC43A2Q8N370 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC43A2Q8N370 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC43A2Q8N370 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC43A2Q8N370 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC43A2Q8N370 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC43A2Q8N370 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC43A2Q8N370 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC43A2Q8N370 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC43A2Q8N370 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC43A2Q8N370 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC43A2Q8N370 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC43A2Q8N370 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC43A2Q8N370 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC43A2Q8N370 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC43A2Q8N370 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC43A2Q8N370 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC43A2Q8N370 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC43A2Q8N370 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC43A2Q8N370 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC43A2Q8N370 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC43A2Q8N370 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC43A2Q8N370 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC43A2Q8N370 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC43A2Q8N370 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC43A2Q8N370 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC43A2Q8N370 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC43A2Q8N370 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC43A2Q8N370 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC43A2Q8N370 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC43A2Q8N370 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC43A2Q8N370 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC43A2Q8N370 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC43A2Q8N370 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC43A2Q8N370 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC43A2Q8N370 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC43A2Q8N370 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC43A2Q8N370 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC43A2Q8N370 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC43A2Q8N370 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC43A2Q8N370 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC43A2Q8N370 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC43A2Q8N370 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC43A2Q8N370 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC43A2Q8N370 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC43A2Q8N370 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC43A2Q8N370 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC43A2Q8N370 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC43A2Q8N370 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC43A2Q8N370 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC43A2Q8N370 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC43A2Q8N370 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC43A2Q8N370 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC43A2Q8N370 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC43A2Q8N370 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC43A2Q8N370 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC43A2Q8N370 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC43A2Q8N370 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC43A2Q8N370 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC43A2Q8N370 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC43A2Q8N370 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC43A2Q8N370 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC43A2Q8N370 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC43A2Q8N370 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC43A2Q8N370 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC43A2Q8N370 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC43A2Q8N370 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC43A2Q8N370 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC43A2Q8N370 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC43A2Q8N370 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC43A2Q8N370 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC43A2Q8N370 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC43A2Q8N370 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC43A2Q8N370 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC43A2Q8N370 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC43A2Q8N370 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms