Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U6

LINC00518, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00518, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00518Q8N0U6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LINC00518Q8N0U6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LINC00518Q8N0U6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LINC00518Q8N0U6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LINC00518Q8N0U6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LINC00518Q8N0U6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LINC00518Q8N0U6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LINC00518Q8N0U6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LINC00518Q8N0U6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LINC00518Q8N0U6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LINC00518Q8N0U6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LINC00518Q8N0U6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LINC00518Q8N0U6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
LINC00518Q8N0U6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LINC00518Q8N0U6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LINC00518Q8N0U6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LINC00518Q8N0U6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LINC00518Q8N0U6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LINC00518Q8N0U6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LINC00518Q8N0U6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LINC00518Q8N0U6 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LINC00518Q8N0U6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LINC00518Q8N0U6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LINC00518Q8N0U6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LINC00518Q8N0U6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LINC00518Q8N0U6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
LINC00518Q8N0U6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LINC00518Q8N0U6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LINC00518Q8N0U6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LINC00518Q8N0U6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LINC00518Q8N0U6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LINC00518Q8N0U6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LINC00518Q8N0U6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LINC00518Q8N0U6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LINC00518Q8N0U6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINC00518Q8N0U6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINC00518Q8N0U6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINC00518Q8N0U6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINC00518Q8N0U6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00518Q8N0U6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00518Q8N0U6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00518Q8N0U6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00518Q8N0U6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00518Q8N0U6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00518Q8N0U6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00518Q8N0U6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00518Q8N0U6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00518Q8N0U6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00518Q8N0U6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00518Q8N0U6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00518Q8N0U6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LINC00518Q8N0U6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC00518Q8N0U6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC00518Q8N0U6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC00518Q8N0U6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC00518Q8N0U6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC00518Q8N0U6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC00518Q8N0U6 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC00518Q8N0U6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC00518Q8N0U6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC00518Q8N0U6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00518Q8N0U6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00518Q8N0U6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00518Q8N0U6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00518Q8N0U6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00518Q8N0U6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00518Q8N0U6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LINC00518Q8N0U6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00518Q8N0U6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00518Q8N0U6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00518Q8N0U6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00518Q8N0U6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00518Q8N0U6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00518Q8N0U6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00518Q8N0U6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00518Q8N0U6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00518Q8N0U6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC00518Q8N0U6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC00518Q8N0U6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
LINC00518Q8N0U6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00518Q8N0U6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00518Q8N0U6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00518Q8N0U6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00518Q8N0U6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00518Q8N0U6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00518Q8N0U6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00518Q8N0U6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00518Q8N0U6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00518Q8N0U6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00518Q8N0U6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00518Q8N0U6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00518Q8N0U6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00518Q8N0U6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00518Q8N0U6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00518Q8N0U6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00518Q8N0U6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00518Q8N0U6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
LINC00518Q8N0U6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00518Q8N0U6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00518Q8N0U6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms