Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV50

LYSMD2, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSMD2Q8IV50 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LYSMD2Q8IV50 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LYSMD2Q8IV50 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LYSMD2Q8IV50 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LYSMD2Q8IV50 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LYSMD2Q8IV50 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LYSMD2Q8IV50 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LYSMD2Q8IV50 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LYSMD2Q8IV50 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LYSMD2Q8IV50 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LYSMD2Q8IV50 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LYSMD2Q8IV50 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LYSMD2Q8IV50 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LYSMD2Q8IV50 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LYSMD2Q8IV50 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LYSMD2Q8IV50 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LYSMD2Q8IV50 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LYSMD2Q8IV50 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LYSMD2Q8IV50 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LYSMD2Q8IV50 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LYSMD2Q8IV50 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LYSMD2Q8IV50 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LYSMD2Q8IV50 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LYSMD2Q8IV50 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LYSMD2Q8IV50 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LYSMD2Q8IV50 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LYSMD2Q8IV50 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LYSMD2Q8IV50 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LYSMD2Q8IV50 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LYSMD2Q8IV50 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LYSMD2Q8IV50 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LYSMD2Q8IV50 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
LYSMD2Q8IV50 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LYSMD2Q8IV50 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LYSMD2Q8IV50 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LYSMD2Q8IV50 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LYSMD2Q8IV50 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LYSMD2Q8IV50 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LYSMD2Q8IV50 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LYSMD2Q8IV50 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LYSMD2Q8IV50 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LYSMD2Q8IV50 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LYSMD2Q8IV50 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LYSMD2Q8IV50 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LYSMD2Q8IV50 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LYSMD2Q8IV50 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LYSMD2Q8IV50 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LYSMD2Q8IV50 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LYSMD2Q8IV50 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LYSMD2Q8IV50 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LYSMD2Q8IV50 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LYSMD2Q8IV50 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LYSMD2Q8IV50 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LYSMD2Q8IV50 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LYSMD2Q8IV50 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LYSMD2Q8IV50 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LYSMD2Q8IV50 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LYSMD2Q8IV50 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LYSMD2Q8IV50 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LYSMD2Q8IV50 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LYSMD2Q8IV50 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LYSMD2Q8IV50 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LYSMD2Q8IV50 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LYSMD2Q8IV50 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LYSMD2Q8IV50 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LYSMD2Q8IV50 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LYSMD2Q8IV50 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LYSMD2Q8IV50 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LYSMD2Q8IV50 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LYSMD2Q8IV50 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LYSMD2Q8IV50 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LYSMD2Q8IV50 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LYSMD2Q8IV50 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LYSMD2Q8IV50 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LYSMD2Q8IV50 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LYSMD2Q8IV50 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LYSMD2Q8IV50 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LYSMD2Q8IV50 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LYSMD2Q8IV50 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LYSMD2Q8IV50 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LYSMD2Q8IV50 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LYSMD2Q8IV50 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LYSMD2Q8IV50 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LYSMD2Q8IV50 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LYSMD2Q8IV50 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LYSMD2Q8IV50 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LYSMD2Q8IV50 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LYSMD2Q8IV50 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LYSMD2Q8IV50 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LYSMD2Q8IV50 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LYSMD2Q8IV50 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LYSMD2Q8IV50 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LYSMD2Q8IV50 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LYSMD2Q8IV50 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LYSMD2Q8IV50 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LYSMD2Q8IV50 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LYSMD2Q8IV50 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LYSMD2Q8IV50 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LYSMD2Q8IV50 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LYSMD2Q8IV50 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms