Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX29P2Q8IUI4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX29P2Q8IUI4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNX29P2Q8IUI4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX29P2Q8IUI4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX29P2Q8IUI4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX29P2Q8IUI4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX29P2Q8IUI4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX29P2Q8IUI4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX29P2Q8IUI4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX29P2Q8IUI4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX29P2Q8IUI4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX29P2Q8IUI4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX29P2Q8IUI4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX29P2Q8IUI4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX29P2Q8IUI4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX29P2Q8IUI4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX29P2Q8IUI4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX29P2Q8IUI4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX29P2Q8IUI4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX29P2Q8IUI4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNX29P2Q8IUI4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX29P2Q8IUI4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX29P2Q8IUI4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX29P2Q8IUI4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX29P2Q8IUI4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX29P2Q8IUI4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX29P2Q8IUI4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX29P2Q8IUI4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX29P2Q8IUI4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX29P2Q8IUI4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX29P2Q8IUI4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX29P2Q8IUI4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX29P2Q8IUI4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX29P2Q8IUI4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX29P2Q8IUI4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX29P2Q8IUI4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX29P2Q8IUI4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX29P2Q8IUI4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX29P2Q8IUI4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX29P2Q8IUI4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX29P2Q8IUI4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX29P2Q8IUI4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX29P2Q8IUI4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX29P2Q8IUI4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX29P2Q8IUI4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX29P2Q8IUI4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX29P2Q8IUI4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX29P2Q8IUI4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX29P2Q8IUI4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX29P2Q8IUI4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX29P2Q8IUI4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX29P2Q8IUI4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX29P2Q8IUI4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX29P2Q8IUI4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX29P2Q8IUI4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX29P2Q8IUI4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX29P2Q8IUI4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX29P2Q8IUI4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX29P2Q8IUI4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX29P2Q8IUI4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX29P2Q8IUI4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX29P2Q8IUI4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX29P2Q8IUI4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX29P2Q8IUI4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX29P2Q8IUI4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX29P2Q8IUI4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX29P2Q8IUI4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX29P2Q8IUI4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX29P2Q8IUI4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX29P2Q8IUI4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX29P2Q8IUI4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNX29P2Q8IUI4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX29P2Q8IUI4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX29P2Q8IUI4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX29P2Q8IUI4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX29P2Q8IUI4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX29P2Q8IUI4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX29P2Q8IUI4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX29P2Q8IUI4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX29P2Q8IUI4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX29P2Q8IUI4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX29P2Q8IUI4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX29P2Q8IUI4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX29P2Q8IUI4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX29P2Q8IUI4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX29P2Q8IUI4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX29P2Q8IUI4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX29P2Q8IUI4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX29P2Q8IUI4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX29P2Q8IUI4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX29P2Q8IUI4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX29P2Q8IUI4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX29P2Q8IUI4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX29P2Q8IUI4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX29P2Q8IUI4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX29P2Q8IUI4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX29P2Q8IUI4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX29P2Q8IUI4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX29P2Q8IUI4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms