Protein–RNA interactions for Protein: Q86YH6

PDSS2, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS2Q86YH6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDSS2Q86YH6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDSS2Q86YH6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDSS2Q86YH6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDSS2Q86YH6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDSS2Q86YH6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDSS2Q86YH6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDSS2Q86YH6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDSS2Q86YH6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDSS2Q86YH6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDSS2Q86YH6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDSS2Q86YH6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDSS2Q86YH6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
PDSS2Q86YH6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
PDSS2Q86YH6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
PDSS2Q86YH6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDSS2Q86YH6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDSS2Q86YH6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDSS2Q86YH6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDSS2Q86YH6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDSS2Q86YH6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PDSS2Q86YH6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDSS2Q86YH6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDSS2Q86YH6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDSS2Q86YH6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDSS2Q86YH6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDSS2Q86YH6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PDSS2Q86YH6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDSS2Q86YH6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PDSS2Q86YH6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDSS2Q86YH6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDSS2Q86YH6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PDSS2Q86YH6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDSS2Q86YH6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDSS2Q86YH6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PDSS2Q86YH6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDSS2Q86YH6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDSS2Q86YH6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDSS2Q86YH6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDSS2Q86YH6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDSS2Q86YH6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDSS2Q86YH6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDSS2Q86YH6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDSS2Q86YH6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDSS2Q86YH6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDSS2Q86YH6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDSS2Q86YH6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDSS2Q86YH6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDSS2Q86YH6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDSS2Q86YH6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDSS2Q86YH6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDSS2Q86YH6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDSS2Q86YH6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDSS2Q86YH6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDSS2Q86YH6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDSS2Q86YH6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDSS2Q86YH6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDSS2Q86YH6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDSS2Q86YH6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDSS2Q86YH6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDSS2Q86YH6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDSS2Q86YH6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDSS2Q86YH6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDSS2Q86YH6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDSS2Q86YH6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDSS2Q86YH6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDSS2Q86YH6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDSS2Q86YH6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDSS2Q86YH6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDSS2Q86YH6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDSS2Q86YH6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDSS2Q86YH6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDSS2Q86YH6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDSS2Q86YH6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDSS2Q86YH6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PDSS2Q86YH6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PDSS2Q86YH6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDSS2Q86YH6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDSS2Q86YH6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDSS2Q86YH6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDSS2Q86YH6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDSS2Q86YH6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDSS2Q86YH6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDSS2Q86YH6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDSS2Q86YH6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDSS2Q86YH6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDSS2Q86YH6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDSS2Q86YH6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDSS2Q86YH6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDSS2Q86YH6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PDSS2Q86YH6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PDSS2Q86YH6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDSS2Q86YH6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDSS2Q86YH6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDSS2Q86YH6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDSS2Q86YH6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDSS2Q86YH6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDSS2Q86YH6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDSS2Q86YH6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDSS2Q86YH6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms