Protein–RNA interactions for Protein: Q86US8

SMG6, Telomerase-binding protein EST1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG6Q86US8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
SMG6Q86US8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
SMG6Q86US8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
SMG6Q86US8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC36.04■■■■□ 3.36
SMG6Q86US8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
SMG6Q86US8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
SMG6Q86US8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
SMG6Q86US8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
SMG6Q86US8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
SMG6Q86US8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
SMG6Q86US8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
SMG6Q86US8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
SMG6Q86US8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
SMG6Q86US8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
SMG6Q86US8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
SMG6Q86US8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
SMG6Q86US8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
SMG6Q86US8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
SMG6Q86US8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
SMG6Q86US8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
SMG6Q86US8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
SMG6Q86US8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
SMG6Q86US8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
SMG6Q86US8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
SMG6Q86US8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
SMG6Q86US8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
SMG6Q86US8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
SMG6Q86US8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
SMG6Q86US8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
SMG6Q86US8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
SMG6Q86US8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
SMG6Q86US8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
SMG6Q86US8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
SMG6Q86US8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
SMG6Q86US8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
SMG6Q86US8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
SMG6Q86US8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.34
SMG6Q86US8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.34
SMG6Q86US8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
SMG6Q86US8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
SMG6Q86US8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
SMG6Q86US8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
SMG6Q86US8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
SMG6Q86US8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC35.87■■■■□ 3.33
SMG6Q86US8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
SMG6Q86US8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
SMG6Q86US8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
SMG6Q86US8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
SMG6Q86US8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
SMG6Q86US8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
SMG6Q86US8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
SMG6Q86US8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
SMG6Q86US8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
SMG6Q86US8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
SMG6Q86US8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
SMG6Q86US8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
SMG6Q86US8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
SMG6Q86US8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
SMG6Q86US8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
SMG6Q86US8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
SMG6Q86US8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
SMG6Q86US8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
SMG6Q86US8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
SMG6Q86US8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
SMG6Q86US8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
SMG6Q86US8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
SMG6Q86US8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC35.76■■■■□ 3.32
SMG6Q86US8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
SMG6Q86US8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
SMG6Q86US8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
SMG6Q86US8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
SMG6Q86US8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
SMG6Q86US8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
SMG6Q86US8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
SMG6Q86US8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
SMG6Q86US8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
SMG6Q86US8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
SMG6Q86US8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
SMG6Q86US8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
SMG6Q86US8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
SMG6Q86US8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
SMG6Q86US8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
SMG6Q86US8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
SMG6Q86US8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
SMG6Q86US8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.3
SMG6Q86US8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
SMG6Q86US8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
SMG6Q86US8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
SMG6Q86US8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
SMG6Q86US8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
SMG6Q86US8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
SMG6Q86US8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
SMG6Q86US8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
SMG6Q86US8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
SMG6Q86US8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
SMG6Q86US8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
SMG6Q86US8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
SMG6Q86US8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
SMG6Q86US8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
SMG6Q86US8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms