Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6W1

TMCO2, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO2Q7Z6W1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
TMCO2Q7Z6W1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
TMCO2Q7Z6W1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
TMCO2Q7Z6W1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
TMCO2Q7Z6W1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
TMCO2Q7Z6W1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
TMCO2Q7Z6W1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
TMCO2Q7Z6W1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
TMCO2Q7Z6W1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TMCO2Q7Z6W1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMCO2Q7Z6W1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMCO2Q7Z6W1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMCO2Q7Z6W1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TMCO2Q7Z6W1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TMCO2Q7Z6W1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMCO2Q7Z6W1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMCO2Q7Z6W1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMCO2Q7Z6W1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMCO2Q7Z6W1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMCO2Q7Z6W1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMCO2Q7Z6W1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMCO2Q7Z6W1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TMCO2Q7Z6W1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TMCO2Q7Z6W1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TMCO2Q7Z6W1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMCO2Q7Z6W1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMCO2Q7Z6W1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMCO2Q7Z6W1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMCO2Q7Z6W1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMCO2Q7Z6W1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMCO2Q7Z6W1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMCO2Q7Z6W1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMCO2Q7Z6W1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMCO2Q7Z6W1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMCO2Q7Z6W1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMCO2Q7Z6W1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMCO2Q7Z6W1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMCO2Q7Z6W1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMCO2Q7Z6W1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMCO2Q7Z6W1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TMCO2Q7Z6W1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TMCO2Q7Z6W1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TMCO2Q7Z6W1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMCO2Q7Z6W1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMCO2Q7Z6W1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMCO2Q7Z6W1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMCO2Q7Z6W1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMCO2Q7Z6W1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMCO2Q7Z6W1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMCO2Q7Z6W1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMCO2Q7Z6W1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMCO2Q7Z6W1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMCO2Q7Z6W1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMCO2Q7Z6W1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMCO2Q7Z6W1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMCO2Q7Z6W1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
TMCO2Q7Z6W1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TMCO2Q7Z6W1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TMCO2Q7Z6W1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TMCO2Q7Z6W1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TMCO2Q7Z6W1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TMCO2Q7Z6W1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TMCO2Q7Z6W1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TMCO2Q7Z6W1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TMCO2Q7Z6W1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TMCO2Q7Z6W1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
TMCO2Q7Z6W1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMCO2Q7Z6W1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMCO2Q7Z6W1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMCO2Q7Z6W1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMCO2Q7Z6W1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMCO2Q7Z6W1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMCO2Q7Z6W1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMCO2Q7Z6W1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMCO2Q7Z6W1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMCO2Q7Z6W1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMCO2Q7Z6W1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TMCO2Q7Z6W1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TMCO2Q7Z6W1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TMCO2Q7Z6W1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
TMCO2Q7Z6W1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TMCO2Q7Z6W1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TMCO2Q7Z6W1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TMCO2Q7Z6W1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TMCO2Q7Z6W1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TMCO2Q7Z6W1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TMCO2Q7Z6W1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TMCO2Q7Z6W1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TMCO2Q7Z6W1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
TMCO2Q7Z6W1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TMCO2Q7Z6W1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TMCO2Q7Z6W1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TMCO2Q7Z6W1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TMCO2Q7Z6W1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TMCO2Q7Z6W1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TMCO2Q7Z6W1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMCO2Q7Z6W1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMCO2Q7Z6W1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TMCO2Q7Z6W1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TMCO2Q7Z6W1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms