Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FAM43BQ6ZT52 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FAM43BQ6ZT52 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FAM43BQ6ZT52 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FAM43BQ6ZT52 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
FAM43BQ6ZT52 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
FAM43BQ6ZT52 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
FAM43BQ6ZT52 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
FAM43BQ6ZT52 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
FAM43BQ6ZT52 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
FAM43BQ6ZT52 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
FAM43BQ6ZT52 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
FAM43BQ6ZT52 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
FAM43BQ6ZT52 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FAM43BQ6ZT52 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FAM43BQ6ZT52 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FAM43BQ6ZT52 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FAM43BQ6ZT52 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FAM43BQ6ZT52 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FAM43BQ6ZT52 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FAM43BQ6ZT52 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FAM43BQ6ZT52 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FAM43BQ6ZT52 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FAM43BQ6ZT52 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FAM43BQ6ZT52 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FAM43BQ6ZT52 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FAM43BQ6ZT52 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FAM43BQ6ZT52 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FAM43BQ6ZT52 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FAM43BQ6ZT52 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FAM43BQ6ZT52 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FAM43BQ6ZT52 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FAM43BQ6ZT52 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FAM43BQ6ZT52 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FAM43BQ6ZT52 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FAM43BQ6ZT52 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FAM43BQ6ZT52 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FAM43BQ6ZT52 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FAM43BQ6ZT52 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FAM43BQ6ZT52 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FAM43BQ6ZT52 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FAM43BQ6ZT52 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FAM43BQ6ZT52 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FAM43BQ6ZT52 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FAM43BQ6ZT52 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FAM43BQ6ZT52 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FAM43BQ6ZT52 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FAM43BQ6ZT52 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FAM43BQ6ZT52 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FAM43BQ6ZT52 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FAM43BQ6ZT52 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FAM43BQ6ZT52 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FAM43BQ6ZT52 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FAM43BQ6ZT52 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
FAM43BQ6ZT52 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FAM43BQ6ZT52 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FAM43BQ6ZT52 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FAM43BQ6ZT52 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FAM43BQ6ZT52 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
FAM43BQ6ZT52 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FAM43BQ6ZT52 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FAM43BQ6ZT52 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FAM43BQ6ZT52 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FAM43BQ6ZT52 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FAM43BQ6ZT52 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FAM43BQ6ZT52 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FAM43BQ6ZT52 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FAM43BQ6ZT52 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
FAM43BQ6ZT52 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FAM43BQ6ZT52 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FAM43BQ6ZT52 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FAM43BQ6ZT52 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FAM43BQ6ZT52 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FAM43BQ6ZT52 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FAM43BQ6ZT52 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FAM43BQ6ZT52 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FAM43BQ6ZT52 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FAM43BQ6ZT52 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FAM43BQ6ZT52 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FAM43BQ6ZT52 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FAM43BQ6ZT52 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FAM43BQ6ZT52 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
FAM43BQ6ZT52 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FAM43BQ6ZT52 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FAM43BQ6ZT52 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FAM43BQ6ZT52 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FAM43BQ6ZT52 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FAM43BQ6ZT52 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FAM43BQ6ZT52 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FAM43BQ6ZT52 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
FAM43BQ6ZT52 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FAM43BQ6ZT52 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FAM43BQ6ZT52 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FAM43BQ6ZT52 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FAM43BQ6ZT52 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FAM43BQ6ZT52 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FAM43BQ6ZT52 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
FAM43BQ6ZT52 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FAM43BQ6ZT52 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FAM43BQ6ZT52 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
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