Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN04

MEX3B, RNA-binding protein MEX3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEX3BQ6ZN04 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEX3BQ6ZN04 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEX3BQ6ZN04 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MEX3BQ6ZN04 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MEX3BQ6ZN04 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MEX3BQ6ZN04 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MEX3BQ6ZN04 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MEX3BQ6ZN04 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MEX3BQ6ZN04 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MEX3BQ6ZN04 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MEX3BQ6ZN04 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MEX3BQ6ZN04 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MEX3BQ6ZN04 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MEX3BQ6ZN04 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MEX3BQ6ZN04 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MEX3BQ6ZN04 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MEX3BQ6ZN04 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MEX3BQ6ZN04 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MEX3BQ6ZN04 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MEX3BQ6ZN04 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MEX3BQ6ZN04 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEX3BQ6ZN04 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEX3BQ6ZN04 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEX3BQ6ZN04 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MEX3BQ6ZN04 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MEX3BQ6ZN04 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MEX3BQ6ZN04 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MEX3BQ6ZN04 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MEX3BQ6ZN04 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MEX3BQ6ZN04 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MEX3BQ6ZN04 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEX3BQ6ZN04 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEX3BQ6ZN04 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MEX3BQ6ZN04 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MEX3BQ6ZN04 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MEX3BQ6ZN04 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MEX3BQ6ZN04 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MEX3BQ6ZN04 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MEX3BQ6ZN04 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MEX3BQ6ZN04 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
MEX3BQ6ZN04 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEX3BQ6ZN04 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEX3BQ6ZN04 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEX3BQ6ZN04 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEX3BQ6ZN04 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEX3BQ6ZN04 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEX3BQ6ZN04 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEX3BQ6ZN04 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEX3BQ6ZN04 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEX3BQ6ZN04 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEX3BQ6ZN04 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEX3BQ6ZN04 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEX3BQ6ZN04 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEX3BQ6ZN04 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEX3BQ6ZN04 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEX3BQ6ZN04 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEX3BQ6ZN04 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MEX3BQ6ZN04 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MEX3BQ6ZN04 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MEX3BQ6ZN04 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MEX3BQ6ZN04 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MEX3BQ6ZN04 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MEX3BQ6ZN04 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MEX3BQ6ZN04 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MEX3BQ6ZN04 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MEX3BQ6ZN04 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MEX3BQ6ZN04 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MEX3BQ6ZN04 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MEX3BQ6ZN04 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MEX3BQ6ZN04 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MEX3BQ6ZN04 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MEX3BQ6ZN04 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MEX3BQ6ZN04 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MEX3BQ6ZN04 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MEX3BQ6ZN04 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MEX3BQ6ZN04 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MEX3BQ6ZN04 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MEX3BQ6ZN04 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MEX3BQ6ZN04 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEX3BQ6ZN04 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEX3BQ6ZN04 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MEX3BQ6ZN04 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MEX3BQ6ZN04 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MEX3BQ6ZN04 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MEX3BQ6ZN04 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MEX3BQ6ZN04 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MEX3BQ6ZN04 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MEX3BQ6ZN04 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MEX3BQ6ZN04 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MEX3BQ6ZN04 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MEX3BQ6ZN04 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MEX3BQ6ZN04 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MEX3BQ6ZN04 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEX3BQ6ZN04 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEX3BQ6ZN04 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEX3BQ6ZN04 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEX3BQ6ZN04 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEX3BQ6ZN04 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEX3BQ6ZN04 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MEX3BQ6ZN04 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms