Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMD2

SPNS3, Protein spinster homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3Q6ZMD2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SPNS3Q6ZMD2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SPNS3Q6ZMD2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPNS3Q6ZMD2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPNS3Q6ZMD2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPNS3Q6ZMD2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPNS3Q6ZMD2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPNS3Q6ZMD2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPNS3Q6ZMD2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPNS3Q6ZMD2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPNS3Q6ZMD2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPNS3Q6ZMD2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPNS3Q6ZMD2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPNS3Q6ZMD2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SPNS3Q6ZMD2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SPNS3Q6ZMD2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SPNS3Q6ZMD2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPNS3Q6ZMD2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPNS3Q6ZMD2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SPNS3Q6ZMD2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPNS3Q6ZMD2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SPNS3Q6ZMD2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SPNS3Q6ZMD2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPNS3Q6ZMD2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SPNS3Q6ZMD2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SPNS3Q6ZMD2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SPNS3Q6ZMD2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPNS3Q6ZMD2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPNS3Q6ZMD2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPNS3Q6ZMD2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPNS3Q6ZMD2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPNS3Q6ZMD2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPNS3Q6ZMD2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPNS3Q6ZMD2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPNS3Q6ZMD2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SPNS3Q6ZMD2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPNS3Q6ZMD2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPNS3Q6ZMD2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPNS3Q6ZMD2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPNS3Q6ZMD2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SPNS3Q6ZMD2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPNS3Q6ZMD2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPNS3Q6ZMD2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPNS3Q6ZMD2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPNS3Q6ZMD2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPNS3Q6ZMD2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPNS3Q6ZMD2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPNS3Q6ZMD2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPNS3Q6ZMD2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPNS3Q6ZMD2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPNS3Q6ZMD2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPNS3Q6ZMD2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SPNS3Q6ZMD2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPNS3Q6ZMD2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPNS3Q6ZMD2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPNS3Q6ZMD2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPNS3Q6ZMD2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPNS3Q6ZMD2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPNS3Q6ZMD2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPNS3Q6ZMD2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPNS3Q6ZMD2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPNS3Q6ZMD2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPNS3Q6ZMD2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPNS3Q6ZMD2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPNS3Q6ZMD2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPNS3Q6ZMD2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPNS3Q6ZMD2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SPNS3Q6ZMD2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPNS3Q6ZMD2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPNS3Q6ZMD2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPNS3Q6ZMD2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPNS3Q6ZMD2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPNS3Q6ZMD2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPNS3Q6ZMD2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPNS3Q6ZMD2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPNS3Q6ZMD2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPNS3Q6ZMD2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPNS3Q6ZMD2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPNS3Q6ZMD2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPNS3Q6ZMD2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPNS3Q6ZMD2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPNS3Q6ZMD2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPNS3Q6ZMD2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPNS3Q6ZMD2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPNS3Q6ZMD2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPNS3Q6ZMD2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPNS3Q6ZMD2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPNS3Q6ZMD2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPNS3Q6ZMD2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPNS3Q6ZMD2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPNS3Q6ZMD2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPNS3Q6ZMD2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SPNS3Q6ZMD2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SPNS3Q6ZMD2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPNS3Q6ZMD2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPNS3Q6ZMD2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPNS3Q6ZMD2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPNS3Q6ZMD2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPNS3Q6ZMD2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPNS3Q6ZMD2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms