Protein–RNA interactions for Protein: Q6PI26

SHQ1, Protein SHQ1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1Q6PI26 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHQ1Q6PI26 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHQ1Q6PI26 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHQ1Q6PI26 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHQ1Q6PI26 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHQ1Q6PI26 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHQ1Q6PI26 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHQ1Q6PI26 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHQ1Q6PI26 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHQ1Q6PI26 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHQ1Q6PI26 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHQ1Q6PI26 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SHQ1Q6PI26 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHQ1Q6PI26 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHQ1Q6PI26 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHQ1Q6PI26 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHQ1Q6PI26 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHQ1Q6PI26 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHQ1Q6PI26 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHQ1Q6PI26 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHQ1Q6PI26 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHQ1Q6PI26 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHQ1Q6PI26 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHQ1Q6PI26 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SHQ1Q6PI26 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHQ1Q6PI26 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHQ1Q6PI26 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHQ1Q6PI26 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHQ1Q6PI26 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SHQ1Q6PI26 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SHQ1Q6PI26 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SHQ1Q6PI26 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SHQ1Q6PI26 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHQ1Q6PI26 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHQ1Q6PI26 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHQ1Q6PI26 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHQ1Q6PI26 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHQ1Q6PI26 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHQ1Q6PI26 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHQ1Q6PI26 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHQ1Q6PI26 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHQ1Q6PI26 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHQ1Q6PI26 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHQ1Q6PI26 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHQ1Q6PI26 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHQ1Q6PI26 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHQ1Q6PI26 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHQ1Q6PI26 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHQ1Q6PI26 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHQ1Q6PI26 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SHQ1Q6PI26 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SHQ1Q6PI26 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHQ1Q6PI26 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHQ1Q6PI26 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHQ1Q6PI26 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHQ1Q6PI26 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHQ1Q6PI26 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHQ1Q6PI26 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHQ1Q6PI26 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHQ1Q6PI26 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHQ1Q6PI26 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHQ1Q6PI26 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHQ1Q6PI26 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHQ1Q6PI26 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHQ1Q6PI26 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHQ1Q6PI26 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHQ1Q6PI26 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHQ1Q6PI26 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHQ1Q6PI26 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHQ1Q6PI26 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHQ1Q6PI26 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHQ1Q6PI26 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHQ1Q6PI26 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHQ1Q6PI26 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHQ1Q6PI26 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHQ1Q6PI26 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SHQ1Q6PI26 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SHQ1Q6PI26 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHQ1Q6PI26 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHQ1Q6PI26 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHQ1Q6PI26 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHQ1Q6PI26 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SHQ1Q6PI26 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHQ1Q6PI26 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHQ1Q6PI26 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHQ1Q6PI26 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHQ1Q6PI26 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHQ1Q6PI26 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHQ1Q6PI26 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHQ1Q6PI26 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHQ1Q6PI26 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHQ1Q6PI26 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SHQ1Q6PI26 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHQ1Q6PI26 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHQ1Q6PI26 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHQ1Q6PI26 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SHQ1Q6PI26 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SHQ1Q6PI26 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SHQ1Q6PI26 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SHQ1Q6PI26 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms