Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZCCHC12Q6PEW1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZCCHC12Q6PEW1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZCCHC12Q6PEW1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZCCHC12Q6PEW1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ZCCHC12Q6PEW1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZCCHC12Q6PEW1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZCCHC12Q6PEW1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZCCHC12Q6PEW1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZCCHC12Q6PEW1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZCCHC12Q6PEW1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZCCHC12Q6PEW1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZCCHC12Q6PEW1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZCCHC12Q6PEW1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZCCHC12Q6PEW1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZCCHC12Q6PEW1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZCCHC12Q6PEW1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZCCHC12Q6PEW1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ZCCHC12Q6PEW1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZCCHC12Q6PEW1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZCCHC12Q6PEW1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZCCHC12Q6PEW1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZCCHC12Q6PEW1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZCCHC12Q6PEW1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZCCHC12Q6PEW1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZCCHC12Q6PEW1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZCCHC12Q6PEW1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZCCHC12Q6PEW1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZCCHC12Q6PEW1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZCCHC12Q6PEW1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZCCHC12Q6PEW1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZCCHC12Q6PEW1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZCCHC12Q6PEW1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZCCHC12Q6PEW1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZCCHC12Q6PEW1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZCCHC12Q6PEW1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZCCHC12Q6PEW1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZCCHC12Q6PEW1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZCCHC12Q6PEW1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZCCHC12Q6PEW1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZCCHC12Q6PEW1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ZCCHC12Q6PEW1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZCCHC12Q6PEW1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZCCHC12Q6PEW1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZCCHC12Q6PEW1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZCCHC12Q6PEW1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZCCHC12Q6PEW1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZCCHC12Q6PEW1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZCCHC12Q6PEW1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZCCHC12Q6PEW1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZCCHC12Q6PEW1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZCCHC12Q6PEW1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZCCHC12Q6PEW1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZCCHC12Q6PEW1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZCCHC12Q6PEW1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZCCHC12Q6PEW1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZCCHC12Q6PEW1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZCCHC12Q6PEW1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZCCHC12Q6PEW1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZCCHC12Q6PEW1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZCCHC12Q6PEW1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZCCHC12Q6PEW1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZCCHC12Q6PEW1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZCCHC12Q6PEW1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZCCHC12Q6PEW1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZCCHC12Q6PEW1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZCCHC12Q6PEW1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZCCHC12Q6PEW1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ZCCHC12Q6PEW1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZCCHC12Q6PEW1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZCCHC12Q6PEW1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZCCHC12Q6PEW1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZCCHC12Q6PEW1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ZCCHC12Q6PEW1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZCCHC12Q6PEW1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZCCHC12Q6PEW1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZCCHC12Q6PEW1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ZCCHC12Q6PEW1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZCCHC12Q6PEW1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZCCHC12Q6PEW1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZCCHC12Q6PEW1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZCCHC12Q6PEW1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZCCHC12Q6PEW1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZCCHC12Q6PEW1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZCCHC12Q6PEW1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZCCHC12Q6PEW1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZCCHC12Q6PEW1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZCCHC12Q6PEW1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZCCHC12Q6PEW1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZCCHC12Q6PEW1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZCCHC12Q6PEW1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ZCCHC12Q6PEW1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZCCHC12Q6PEW1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZCCHC12Q6PEW1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZCCHC12Q6PEW1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZCCHC12Q6PEW1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZCCHC12Q6PEW1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ZCCHC12Q6PEW1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms