Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU9

C9orf84, Uncharacterized protein C9orf84, humanhuman

Predictions only

Length 1,444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf84Q5VXU9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
C9orf84Q5VXU9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC40.54■■■■■ 4.08
C9orf84Q5VXU9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
C9orf84Q5VXU9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
C9orf84Q5VXU9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
C9orf84Q5VXU9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC40.5■■■■■ 4.07
C9orf84Q5VXU9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC40.49■■■■■ 4.07
C9orf84Q5VXU9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC40.49■■■■■ 4.07
C9orf84Q5VXU9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
C9orf84Q5VXU9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
C9orf84Q5VXU9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
C9orf84Q5VXU9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC40.47■■■■■ 4.07
C9orf84Q5VXU9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
C9orf84Q5VXU9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
C9orf84Q5VXU9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
C9orf84Q5VXU9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC40.45■■■■■ 4.07
C9orf84Q5VXU9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC40.45■■■■■ 4.07
C9orf84Q5VXU9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC40.45■■■■■ 4.07
C9orf84Q5VXU9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC40.45■■■■■ 4.07
C9orf84Q5VXU9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC40.45■■■■■ 4.07
C9orf84Q5VXU9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC40.45■■■■■ 4.07
C9orf84Q5VXU9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC40.45■■■■■ 4.07
C9orf84Q5VXU9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC40.45■■■■■ 4.07
C9orf84Q5VXU9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC40.45■■■■■ 4.07
C9orf84Q5VXU9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
C9orf84Q5VXU9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC40.43■■■■■ 4.06
C9orf84Q5VXU9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
C9orf84Q5VXU9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC40.42■■■■■ 4.06
C9orf84Q5VXU9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC40.41■■■■■ 4.06
C9orf84Q5VXU9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.05
C9orf84Q5VXU9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.38■■■■■ 4.05
C9orf84Q5VXU9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.05
C9orf84Q5VXU9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
C9orf84Q5VXU9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC40.36■■■■■ 4.05
C9orf84Q5VXU9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
C9orf84Q5VXU9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
C9orf84Q5VXU9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.32■■■■■ 4.05
C9orf84Q5VXU9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC40.32■■■■■ 4.04
C9orf84Q5VXU9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC40.32■■■■■ 4.04
C9orf84Q5VXU9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
C9orf84Q5VXU9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
C9orf84Q5VXU9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC40.31■■■■■ 4.04
C9orf84Q5VXU9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC40.31■■■■■ 4.04
C9orf84Q5VXU9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC40.3■■■■■ 4.04
C9orf84Q5VXU9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
C9orf84Q5VXU9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.29■■■■■ 4.04
C9orf84Q5VXU9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
C9orf84Q5VXU9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC40.28■■■■■ 4.04
C9orf84Q5VXU9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.27■■■■■ 4.04
C9orf84Q5VXU9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
C9orf84Q5VXU9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
C9orf84Q5VXU9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
C9orf84Q5VXU9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
C9orf84Q5VXU9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
C9orf84Q5VXU9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
C9orf84Q5VXU9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
C9orf84Q5VXU9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
C9orf84Q5VXU9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
C9orf84Q5VXU9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
C9orf84Q5VXU9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.26■■■■■ 4.03
C9orf84Q5VXU9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
C9orf84Q5VXU9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
C9orf84Q5VXU9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
C9orf84Q5VXU9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
C9orf84Q5VXU9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
C9orf84Q5VXU9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.22■■■■■ 4.03
C9orf84Q5VXU9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
C9orf84Q5VXU9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
C9orf84Q5VXU9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
C9orf84Q5VXU9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.17■■■■■ 4.02
C9orf84Q5VXU9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC40.17■■■■■ 4.02
C9orf84Q5VXU9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
C9orf84Q5VXU9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
C9orf84Q5VXU9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
C9orf84Q5VXU9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC40.14■■■■■ 4.02
C9orf84Q5VXU9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
C9orf84Q5VXU9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC40.12■■■■■ 4.01
C9orf84Q5VXU9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC40.12■■■■■ 4.01
C9orf84Q5VXU9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
C9orf84Q5VXU9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC40.08■■■■■ 4.01
C9orf84Q5VXU9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
C9orf84Q5VXU9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
C9orf84Q5VXU9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
C9orf84Q5VXU9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
C9orf84Q5VXU9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC40.06■■■■■ 4
C9orf84Q5VXU9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
C9orf84Q5VXU9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
C9orf84Q5VXU9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
C9orf84Q5VXU9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
C9orf84Q5VXU9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
C9orf84Q5VXU9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
C9orf84Q5VXU9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC40.04■■■■■ 4
C9orf84Q5VXU9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
C9orf84Q5VXU9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
C9orf84Q5VXU9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC40.01■■■■■ 4
C9orf84Q5VXU9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.01■■■■■ 4
C9orf84Q5VXU9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
C9orf84Q5VXU9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC39.99■■■■□ 3.99
C9orf84Q5VXU9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC39.99■■■■□ 3.99
C9orf84Q5VXU9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms