Protein–RNA interactions for Protein: Q5J8M3

EMC4, ER membrane protein complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC4Q5J8M3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EMC4Q5J8M3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EMC4Q5J8M3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
EMC4Q5J8M3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
EMC4Q5J8M3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EMC4Q5J8M3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EMC4Q5J8M3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EMC4Q5J8M3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EMC4Q5J8M3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EMC4Q5J8M3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EMC4Q5J8M3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EMC4Q5J8M3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EMC4Q5J8M3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EMC4Q5J8M3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EMC4Q5J8M3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EMC4Q5J8M3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EMC4Q5J8M3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EMC4Q5J8M3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EMC4Q5J8M3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EMC4Q5J8M3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EMC4Q5J8M3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EMC4Q5J8M3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EMC4Q5J8M3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EMC4Q5J8M3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EMC4Q5J8M3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EMC4Q5J8M3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EMC4Q5J8M3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EMC4Q5J8M3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EMC4Q5J8M3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
EMC4Q5J8M3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EMC4Q5J8M3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EMC4Q5J8M3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EMC4Q5J8M3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EMC4Q5J8M3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EMC4Q5J8M3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EMC4Q5J8M3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EMC4Q5J8M3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EMC4Q5J8M3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EMC4Q5J8M3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EMC4Q5J8M3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
EMC4Q5J8M3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
EMC4Q5J8M3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EMC4Q5J8M3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EMC4Q5J8M3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
EMC4Q5J8M3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EMC4Q5J8M3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EMC4Q5J8M3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EMC4Q5J8M3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EMC4Q5J8M3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EMC4Q5J8M3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EMC4Q5J8M3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EMC4Q5J8M3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
EMC4Q5J8M3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
EMC4Q5J8M3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EMC4Q5J8M3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EMC4Q5J8M3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EMC4Q5J8M3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EMC4Q5J8M3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
EMC4Q5J8M3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EMC4Q5J8M3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EMC4Q5J8M3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EMC4Q5J8M3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EMC4Q5J8M3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EMC4Q5J8M3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
EMC4Q5J8M3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EMC4Q5J8M3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EMC4Q5J8M3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EMC4Q5J8M3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EMC4Q5J8M3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EMC4Q5J8M3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EMC4Q5J8M3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EMC4Q5J8M3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EMC4Q5J8M3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EMC4Q5J8M3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EMC4Q5J8M3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EMC4Q5J8M3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EMC4Q5J8M3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EMC4Q5J8M3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EMC4Q5J8M3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EMC4Q5J8M3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EMC4Q5J8M3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EMC4Q5J8M3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EMC4Q5J8M3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EMC4Q5J8M3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EMC4Q5J8M3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EMC4Q5J8M3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EMC4Q5J8M3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EMC4Q5J8M3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EMC4Q5J8M3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
EMC4Q5J8M3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EMC4Q5J8M3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EMC4Q5J8M3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EMC4Q5J8M3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EMC4Q5J8M3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EMC4Q5J8M3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EMC4Q5J8M3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EMC4Q5J8M3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EMC4Q5J8M3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EMC4Q5J8M3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EMC4Q5J8M3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms