Protein–RNA interactions for Protein: Q56P42

PYDC2, Pyrin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYDC2Q56P42 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PYDC2Q56P42 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PYDC2Q56P42 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PYDC2Q56P42 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PYDC2Q56P42 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PYDC2Q56P42 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PYDC2Q56P42 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PYDC2Q56P42 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PYDC2Q56P42 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PYDC2Q56P42 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PYDC2Q56P42 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PYDC2Q56P42 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PYDC2Q56P42 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PYDC2Q56P42 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PYDC2Q56P42 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PYDC2Q56P42 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PYDC2Q56P42 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PYDC2Q56P42 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PYDC2Q56P42 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PYDC2Q56P42 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PYDC2Q56P42 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PYDC2Q56P42 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PYDC2Q56P42 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PYDC2Q56P42 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PYDC2Q56P42 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PYDC2Q56P42 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PYDC2Q56P42 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PYDC2Q56P42 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PYDC2Q56P42 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PYDC2Q56P42 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PYDC2Q56P42 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PYDC2Q56P42 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PYDC2Q56P42 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PYDC2Q56P42 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PYDC2Q56P42 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PYDC2Q56P42 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PYDC2Q56P42 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PYDC2Q56P42 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PYDC2Q56P42 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PYDC2Q56P42 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PYDC2Q56P42 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PYDC2Q56P42 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PYDC2Q56P42 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PYDC2Q56P42 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PYDC2Q56P42 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PYDC2Q56P42 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PYDC2Q56P42 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PYDC2Q56P42 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PYDC2Q56P42 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PYDC2Q56P42 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PYDC2Q56P42 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PYDC2Q56P42 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PYDC2Q56P42 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PYDC2Q56P42 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PYDC2Q56P42 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PYDC2Q56P42 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PYDC2Q56P42 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PYDC2Q56P42 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PYDC2Q56P42 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PYDC2Q56P42 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PYDC2Q56P42 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PYDC2Q56P42 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PYDC2Q56P42 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PYDC2Q56P42 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PYDC2Q56P42 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PYDC2Q56P42 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PYDC2Q56P42 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PYDC2Q56P42 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PYDC2Q56P42 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PYDC2Q56P42 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PYDC2Q56P42 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PYDC2Q56P42 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PYDC2Q56P42 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PYDC2Q56P42 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PYDC2Q56P42 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PYDC2Q56P42 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PYDC2Q56P42 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PYDC2Q56P42 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PYDC2Q56P42 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PYDC2Q56P42 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PYDC2Q56P42 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PYDC2Q56P42 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PYDC2Q56P42 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PYDC2Q56P42 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PYDC2Q56P42 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PYDC2Q56P42 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PYDC2Q56P42 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PYDC2Q56P42 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PYDC2Q56P42 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PYDC2Q56P42 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PYDC2Q56P42 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PYDC2Q56P42 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PYDC2Q56P42 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PYDC2Q56P42 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PYDC2Q56P42 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PYDC2Q56P42 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PYDC2Q56P42 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PYDC2Q56P42 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PYDC2Q56P42 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PYDC2Q56P42 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms