Protein–RNA interactions for Protein: Q31612

HLA-B, HLA class I histocompatibility antigen, B-73 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-BQ31612 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
HLA-BQ31612 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
HLA-BQ31612 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HLA-BQ31612 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HLA-BQ31612 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HLA-BQ31612 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HLA-BQ31612 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HLA-BQ31612 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HLA-BQ31612 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HLA-BQ31612 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HLA-BQ31612 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HLA-BQ31612 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HLA-BQ31612 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HLA-BQ31612 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HLA-BQ31612 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HLA-BQ31612 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HLA-BQ31612 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HLA-BQ31612 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HLA-BQ31612 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HLA-BQ31612 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HLA-BQ31612 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HLA-BQ31612 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HLA-BQ31612 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HLA-BQ31612 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HLA-BQ31612 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HLA-BQ31612 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
HLA-BQ31612 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
HLA-BQ31612 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HLA-BQ31612 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HLA-BQ31612 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
HLA-BQ31612 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HLA-BQ31612 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HLA-BQ31612 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HLA-BQ31612 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HLA-BQ31612 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HLA-BQ31612 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HLA-BQ31612 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
HLA-BQ31612 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HLA-BQ31612 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HLA-BQ31612 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HLA-BQ31612 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HLA-BQ31612 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HLA-BQ31612 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HLA-BQ31612 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HLA-BQ31612 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HLA-BQ31612 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HLA-BQ31612 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
HLA-BQ31612 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HLA-BQ31612 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HLA-BQ31612 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HLA-BQ31612 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HLA-BQ31612 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HLA-BQ31612 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HLA-BQ31612 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HLA-BQ31612 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HLA-BQ31612 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HLA-BQ31612 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HLA-BQ31612 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HLA-BQ31612 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HLA-BQ31612 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HLA-BQ31612 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HLA-BQ31612 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HLA-BQ31612 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HLA-BQ31612 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HLA-BQ31612 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HLA-BQ31612 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HLA-BQ31612 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HLA-BQ31612 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HLA-BQ31612 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HLA-BQ31612 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HLA-BQ31612 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HLA-BQ31612 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HLA-BQ31612 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HLA-BQ31612 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HLA-BQ31612 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HLA-BQ31612 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HLA-BQ31612 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HLA-BQ31612 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HLA-BQ31612 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HLA-BQ31612 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HLA-BQ31612 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HLA-BQ31612 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HLA-BQ31612 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HLA-BQ31612 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HLA-BQ31612 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HLA-BQ31612 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HLA-BQ31612 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HLA-BQ31612 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HLA-BQ31612 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HLA-BQ31612 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
HLA-BQ31612 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HLA-BQ31612 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HLA-BQ31612 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HLA-BQ31612 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HLA-BQ31612 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HLA-BQ31612 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HLA-BQ31612 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HLA-BQ31612 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HLA-BQ31612 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HLA-BQ31612 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms