Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBM39Q14498 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBM39Q14498 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBM39Q14498 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBM39Q14498 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBM39Q14498 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBM39Q14498 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBM39Q14498 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBM39Q14498 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBM39Q14498 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBM39Q14498 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBM39Q14498 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBM39Q14498 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBM39Q14498 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM39Q14498 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM39Q14498 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBM39Q14498 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBM39Q14498 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBM39Q14498 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBM39Q14498 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBM39Q14498 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBM39Q14498 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBM39Q14498 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBM39Q14498 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBM39Q14498 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBM39Q14498 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBM39Q14498 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBM39Q14498 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBM39Q14498 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBM39Q14498 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM39Q14498 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM39Q14498 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM39Q14498 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBM39Q14498 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBM39Q14498 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBM39Q14498 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBM39Q14498 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBM39Q14498 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM39Q14498 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM39Q14498 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM39Q14498 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM39Q14498 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBM39Q14498 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBM39Q14498 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBM39Q14498 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM39Q14498 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM39Q14498 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBM39Q14498 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBM39Q14498 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBM39Q14498 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBM39Q14498 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBM39Q14498 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBM39Q14498 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RBM39Q14498 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM39Q14498 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM39Q14498 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM39Q14498 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM39Q14498 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM39Q14498 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM39Q14498 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM39Q14498 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM39Q14498 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM39Q14498 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM39Q14498 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM39Q14498 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM39Q14498 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM39Q14498 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM39Q14498 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM39Q14498 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM39Q14498 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM39Q14498 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM39Q14498 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM39Q14498 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM39Q14498 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM39Q14498 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM39Q14498 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM39Q14498 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBM39Q14498 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBM39Q14498 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RBM39Q14498 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBM39Q14498 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBM39Q14498 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBM39Q14498 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBM39Q14498 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBM39Q14498 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBM39Q14498 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RBM39Q14498 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBM39Q14498 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RBM39Q14498 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
RBM39Q14498 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RBM39Q14498 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RBM39Q14498 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RBM39Q14498 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RBM39Q14498 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBM39Q14498 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBM39Q14498 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBM39Q14498 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBM39Q14498 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBM39Q14498 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBM39Q14498 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms