Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LSAMPQ13449 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LSAMPQ13449 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LSAMPQ13449 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LSAMPQ13449 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LSAMPQ13449 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LSAMPQ13449 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LSAMPQ13449 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LSAMPQ13449 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LSAMPQ13449 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LSAMPQ13449 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LSAMPQ13449 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LSAMPQ13449 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LSAMPQ13449 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LSAMPQ13449 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LSAMPQ13449 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LSAMPQ13449 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LSAMPQ13449 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LSAMPQ13449 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LSAMPQ13449 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSAMPQ13449 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSAMPQ13449 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSAMPQ13449 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSAMPQ13449 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LSAMPQ13449 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LSAMPQ13449 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LSAMPQ13449 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LSAMPQ13449 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LSAMPQ13449 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LSAMPQ13449 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LSAMPQ13449 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LSAMPQ13449 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LSAMPQ13449 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LSAMPQ13449 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LSAMPQ13449 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LSAMPQ13449 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LSAMPQ13449 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LSAMPQ13449 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LSAMPQ13449 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LSAMPQ13449 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LSAMPQ13449 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LSAMPQ13449 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LSAMPQ13449 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LSAMPQ13449 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LSAMPQ13449 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LSAMPQ13449 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LSAMPQ13449 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LSAMPQ13449 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LSAMPQ13449 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LSAMPQ13449 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LSAMPQ13449 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LSAMPQ13449 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LSAMPQ13449 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LSAMPQ13449 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LSAMPQ13449 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LSAMPQ13449 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LSAMPQ13449 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LSAMPQ13449 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LSAMPQ13449 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LSAMPQ13449 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LSAMPQ13449 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSAMPQ13449 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LSAMPQ13449 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LSAMPQ13449 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LSAMPQ13449 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LSAMPQ13449 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LSAMPQ13449 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LSAMPQ13449 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LSAMPQ13449 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LSAMPQ13449 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LSAMPQ13449 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LSAMPQ13449 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LSAMPQ13449 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LSAMPQ13449 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LSAMPQ13449 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LSAMPQ13449 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LSAMPQ13449 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LSAMPQ13449 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LSAMPQ13449 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LSAMPQ13449 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LSAMPQ13449 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LSAMPQ13449 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LSAMPQ13449 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LSAMPQ13449 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LSAMPQ13449 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LSAMPQ13449 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LSAMPQ13449 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LSAMPQ13449 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LSAMPQ13449 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LSAMPQ13449 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LSAMPQ13449 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LSAMPQ13449 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LSAMPQ13449 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LSAMPQ13449 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LSAMPQ13449 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LSAMPQ13449 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LSAMPQ13449 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LSAMPQ13449 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LSAMPQ13449 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LSAMPQ13449 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms