Protein–RNA interactions for Protein: Q12751

RTP1, RNA polymerase II assembly factor RTP1, yeastyeast

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTP1Q12751 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt9.65□□□□□ -0.86
RTP1Q12751 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt9.65□□□□□ -0.86
RTP1Q12751 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt9.65□□□□□ -0.86
RTP1Q12751 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt9.65□□□□□ -0.86
RTP1Q12751 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt9.65□□□□□ -0.86
RTP1Q12751 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt9.65□□□□□ -0.86
RTP1Q12751 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt9.65□□□□□ -0.86
RTP1Q12751 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt9.65□□□□□ -0.86
RTP1Q12751 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt9.65□□□□□ -0.86
RTP1Q12751 PET8YNL003C 855 nt9.64□□□□□ -0.87
RTP1Q12751 ILV3YJR016C 1758 nt9.64□□□□□ -0.87
RTP1Q12751 MET2YNL277W 1461 nt9.62□□□□□ -0.87
RTP1Q12751 SWM1YDR260C 513 nt9.6□□□□□ -0.87
RTP1Q12751 SPS100YHR139C 981 nt9.6□□□□□ -0.87
RTP1Q12751 IMO32YGR031W 1029 nt9.59□□□□□ -0.87
RTP1Q12751 RSC4YKR008W 1878 nt9.58□□□□□ -0.88
RTP1Q12751 DDI1YER143W 1287 nt9.58□□□□□ -0.88
RTP1Q12751 DLD2YDL178W 1593 nt9.58□□□□□ -0.88
RTP1Q12751 OSH7YHR001W 1314 nt9.57□□□□□ -0.88
RTP1Q12751 CDD1YLR245C 429 nt9.57□□□□□ -0.88
RTP1Q12751 YOR325WYOR325W 474 nt9.56□□□□□ -0.88
RTP1Q12751 DTR1YBR180W 1719 nt9.56□□□□□ -0.88
RTP1Q12751 LYS20YDL182W 1287 nt9.55□□□□□ -0.88
RTP1Q12751 YMR007WYMR007W 381 nt9.55□□□□□ -0.88
RTP1Q12751 ILV2YMR108W 2064 nt9.55□□□□□ -0.88
RTP1Q12751 YDR306CYDR306C 1437 nt9.55□□□□□ -0.88
RTP1Q12751 LSM5YER146W 282 nt9.54□□□□□ -0.88
RTP1Q12751 NAS2YIL007C 663 nt9.54□□□□□ -0.88
RTP1Q12751 FLX1YIL134W 936 nt9.54□□□□□ -0.88
RTP1Q12751 FLR1YBR008C 1647 nt9.53□□□□□ -0.88
RTP1Q12751 RCR1YBR005W 642 nt9.53□□□□□ -0.88
RTP1Q12751 SOL2YCR073W-A 948 nt9.52□□□□□ -0.89
RTP1Q12751 UGP1YKL035W 1500 nt9.51□□□□□ -0.89
RTP1Q12751 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt9.5□□□□□ -0.89
RTP1Q12751 SFP1YLR403W 2052 nt9.49□□□□□ -0.89
RTP1Q12751 THP3YPR045C 1413 nt9.49□□□□□ -0.89
RTP1Q12751 COQ8YGL119W 1506 nt9.49□□□□□ -0.89
RTP1Q12751 RFC1YOR217W 2586 nt9.49□□□□□ -0.89
RTP1Q12751 RSC8YFR037C 1674 nt9.48□□□□□ -0.89
RTP1Q12751 YPS3YLR121C 1527 nt9.48□□□□□ -0.89
RTP1Q12751 ABZ2YMR289W 1125 nt9.48□□□□□ -0.89
RTP1Q12751 RRT8YOL048C 1029 nt9.48□□□□□ -0.89
RTP1Q12751 YOR343CYOR343C 327 nt9.48□□□□□ -0.89
RTP1Q12751 Q0010Q0010 387 nt9.48□□□□□ -0.89
RTP1Q12751 YMR209CYMR209C 1374 nt9.48□□□□□ -0.89
RTP1Q12751 RPL12BYDR418W 498 nt9.47□□□□□ -0.89
RTP1Q12751 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt9.47□□□□□ -0.89
RTP1Q12751 OPI10YOL032W 741 nt9.47□□□□□ -0.89
RTP1Q12751 HIS2YFR025C 1008 nt9.46□□□□□ -0.9
RTP1Q12751 SER2YGR208W 930 nt9.45□□□□□ -0.9
RTP1Q12751 FSH2YMR222C 672 nt9.45□□□□□ -0.9
RTP1Q12751 NPP1YCR026C 2229 nt9.45□□□□□ -0.9
RTP1Q12751 FMS1YMR020W 1527 nt9.45□□□□□ -0.9
RTP1Q12751 ADE8YDR408C 645 nt9.44□□□□□ -0.9
RTP1Q12751 SPE2YOL052C 1191 nt9.44□□□□□ -0.9
RTP1Q12751 HMG2YLR450W 3138 nt9.44□□□□□ -0.9
RTP1Q12751 ARO8YGL202W 1503 nt9.43□□□□□ -0.9
RTP1Q12751 HEM13YDR044W 987 nt9.43□□□□□ -0.9
RTP1Q12751 TVP23YDR084C 600 nt9.43□□□□□ -0.9
RTP1Q12751 CYC3YAL039C 810 nt9.42□□□□□ -0.9
RTP1Q12751 PAU21YOR394W 495 nt9.42□□□□□ -0.9
RTP1Q12751 PAU22YPL282C 495 nt9.42□□□□□ -0.9
RTP1Q12751 PUS7YOR243C 2031 nt9.41□□□□□ -0.9
RTP1Q12751 PHB2YGR231C 933 nt9.41□□□□□ -0.9
RTP1Q12751 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt9.41□□□□□ -0.9
RTP1Q12751 ADH3YMR083W 1128 nt9.41□□□□□ -0.9
RTP1Q12751 HTS1YPR033C 1641 nt9.41□□□□□ -0.9
RTP1Q12751 SPP2YOR148C 558 nt9.4□□□□□ -0.9
RTP1Q12751 YDR455CYDR455C 309 nt9.39□□□□□ -0.91
RTP1Q12751 MOB1YIL106W 945 nt9.39□□□□□ -0.91
RTP1Q12751 BET2YPR176C 978 nt9.39□□□□□ -0.91
RTP1Q12751 ZAP1YJL056C 2643 nt9.39□□□□□ -0.91
RTP1Q12751 SGA1YIL099W 1650 nt9.39□□□□□ -0.91
RTP1Q12751 TAT2YOL020W 1779 nt9.38□□□□□ -0.91
RTP1Q12751 HRA1HRA1 564 nt9.38□□□□□ -0.91
RTP1Q12751 ASP3-1YLR155C 1089 nt9.38□□□□□ -0.91
RTP1Q12751 ASP3-2YLR157C 1089 nt9.38□□□□□ -0.91
RTP1Q12751 ASP3-3YLR158C 1089 nt9.38□□□□□ -0.91
RTP1Q12751 ASP3-4YLR160C 1089 nt9.38□□□□□ -0.91
RTP1Q12751 TPO4YOR273C 1980 nt9.37□□□□□ -0.91
RTP1Q12751 YHL008CYHL008C 1884 nt9.37□□□□□ -0.91
RTP1Q12751 CCT2YIL142W 1584 nt9.37□□□□□ -0.91
RTP1Q12751 KES1YPL145C 1305 nt9.36□□□□□ -0.91
RTP1Q12751 LSB6YJL100W 1824 nt9.36□□□□□ -0.91
RTP1Q12751 YOR268CYOR268C 399 nt9.36□□□□□ -0.91
RTP1Q12751 ERG13YML126C 1476 nt9.35□□□□□ -0.91
RTP1Q12751 CWC15YDR163W 528 nt9.33□□□□□ -0.92
RTP1Q12751 PCP1YGR101W 1041 nt9.33□□□□□ -0.92
RTP1Q12751 ENO2YHR174W 1314 nt9.32□□□□□ -0.92
RTP1Q12751 GRH1YDR517W 1119 nt9.32□□□□□ -0.92
RTP1Q12751 OPI3YJR073C 621 nt9.31□□□□□ -0.92
RTP1Q12751 PSD1YNL169C 1503 nt9.31□□□□□ -0.92
RTP1Q12751 VPS62YGR141W 1404 nt9.31□□□□□ -0.92
RTP1Q12751 GNP1YDR508C 1992 nt9.3□□□□□ -0.92
RTP1Q12751 DIG1YPL049C 1359 nt9.3□□□□□ -0.92
RTP1Q12751 YJR154WYJR154W 1041 nt9.3□□□□□ -0.92
RTP1Q12751 MFG1YDL233W 1377 nt9.29□□□□□ -0.92
RTP1Q12751 TPC1YGR096W 945 nt9.29□□□□□ -0.92
RTP1Q12751 SRP102YKL154W 735 nt9.29□□□□□ -0.92
RTP1Q12751 AMF1YOR378W 1548 nt9.29□□□□□ -0.92
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