Protein–RNA interactions for Protein: Q12749

SMC6, Structural maintenance of chromosomes protein 6, yeastyeast

Predictions only

Length 1,114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SMC6Q12749 TPO4YOR273C 1980 nt9.76□□□□□ -0.85
SMC6Q12749 AIM1YAL046C 357 nt9.76□□□□□ -0.85
SMC6Q12749 YHL008CYHL008C 1884 nt9.75□□□□□ -0.85
SMC6Q12749 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt9.75□□□□□ -0.85
SMC6Q12749 SPS100YHR139C 981 nt9.75□□□□□ -0.85
SMC6Q12749 ADE8YDR408C 645 nt9.74□□□□□ -0.85
SMC6Q12749 GSF2YML048W 1212 nt9.74□□□□□ -0.85
SMC6Q12749 YBR232CYBR232C 360 nt9.74□□□□□ -0.85
SMC6Q12749 LSB6YJL100W 1824 nt9.74□□□□□ -0.85
SMC6Q12749 ARO8YGL202W 1503 nt9.73□□□□□ -0.85
SMC6Q12749 PSD1YNL169C 1503 nt9.73□□□□□ -0.85
SMC6Q12749 BET2YPR176C 978 nt9.73□□□□□ -0.85
SMC6Q12749 ENT4YLL038C 744 nt9.71□□□□□ -0.86
SMC6Q12749 DIG1YPL049C 1359 nt9.71□□□□□ -0.86
SMC6Q12749 SEN2YLR105C 1134 nt9.7□□□□□ -0.86
SMC6Q12749 TUB4YLR212C 1422 nt9.7□□□□□ -0.86
SMC6Q12749 YJR114WYJR114W 393 nt9.69□□□□□ -0.86
SMC6Q12749 CYT1YOR065W 930 nt9.69□□□□□ -0.86
SMC6Q12749 KES1YPL145C 1305 nt9.69□□□□□ -0.86
SMC6Q12749 SGA1YIL099W 1650 nt9.68□□□□□ -0.86
SMC6Q12749 QDR2YIL121W 1629 nt9.68□□□□□ -0.86
SMC6Q12749 TVP23YDR084C 600 nt9.68□□□□□ -0.86
SMC6Q12749 APS2YJR058C 444 nt9.68□□□□□ -0.86
SMC6Q12749 NPP1YCR026C 2229 nt9.67□□□□□ -0.86
SMC6Q12749 NIF3YGL221C 867 nt9.67□□□□□ -0.86
SMC6Q12749 YLR046CYLR046C 813 nt9.67□□□□□ -0.86
SMC6Q12749 SAC7YDR389W 1965 nt9.66□□□□□ -0.86
SMC6Q12749 GID7YCL039W 2238 nt9.64□□□□□ -0.87
SMC6Q12749 PAR32YDL173W 888 nt9.64□□□□□ -0.87
SMC6Q12749 OPI3YJR073C 621 nt9.64□□□□□ -0.87
SMC6Q12749 ABZ2YMR289W 1125 nt9.64□□□□□ -0.87
SMC6Q12749 DMA2YNL116W 1569 nt9.63□□□□□ -0.87
SMC6Q12749 NAP1YKR048C 1254 nt9.62□□□□□ -0.87
SMC6Q12749 YJL064WYJL064W 396 nt9.59□□□□□ -0.87
SMC6Q12749 YNR064CYNR064C 873 nt9.58□□□□□ -0.88
SMC6Q12749 ZAP1YJL056C 2643 nt9.57□□□□□ -0.88
SMC6Q12749 DLD3YEL071W 1491 nt9.57□□□□□ -0.88
SMC6Q12749 HXK1YFR053C 1458 nt9.56□□□□□ -0.88
SMC6Q12749 GID8YMR135C 1368 nt9.56□□□□□ -0.88
SMC6Q12749 KRE1YNL322C 942 nt9.56□□□□□ -0.88
SMC6Q12749 ENO2YHR174W 1314 nt9.56□□□□□ -0.88
SMC6Q12749 ITR2YOL103W 1830 nt9.55□□□□□ -0.88
SMC6Q12749 IGD1YFR017C 588 nt9.54□□□□□ -0.88
SMC6Q12749 PAU19YMR325W 375 nt9.54□□□□□ -0.88
SMC6Q12749 PUP1YOR157C 786 nt9.54□□□□□ -0.88
SMC6Q12749 AMF1YOR378W 1548 nt9.53□□□□□ -0.88
SMC6Q12749 ELO1YJL196C 933 nt9.53□□□□□ -0.88
SMC6Q12749 ALD5YER073W 1563 nt9.52□□□□□ -0.89
SMC6Q12749 YHR219WYHR219W 1875 nt9.52□□□□□ -0.89
SMC6Q12749 PCP1YGR101W 1041 nt9.51□□□□□ -0.89
SMC6Q12749 NAS2YIL007C 663 nt9.51□□□□□ -0.89
SMC6Q12749 YHR218WYHR218W 1812 nt9.51□□□□□ -0.89
SMC6Q12749 URA8YJR103W 1737 nt9.51□□□□□ -0.89
SMC6Q12749 YKL133CYKL133C 1392 nt9.5□□□□□ -0.89
SMC6Q12749 KEL3YPL263C 1956 nt9.5□□□□□ -0.89
SMC6Q12749 MRS6YOR370C 1812 nt9.5□□□□□ -0.89
SMC6Q12749 TPC1YGR096W 945 nt9.5□□□□□ -0.89
SMC6Q12749 SPE2YOL052C 1191 nt9.5□□□□□ -0.89
SMC6Q12749 CDD1YLR245C 429 nt9.49□□□□□ -0.89
SMC6Q12749 ODC1YPL134C 933 nt9.48□□□□□ -0.89
SMC6Q12749 TIP1YBR067C 633 nt9.48□□□□□ -0.89
SMC6Q12749 THP3YPR045C 1413 nt9.48□□□□□ -0.89
SMC6Q12749 LSR1LSR1 1175 nt9.47□□□□□ -0.89
SMC6Q12749 VMA11YPL234C 495 nt9.46□□□□□ -0.9
SMC6Q12749 ESBP6YNL125C 2022 nt9.45□□□□□ -0.9
SMC6Q12749 SWT21YNL187W 1074 nt9.45□□□□□ -0.9
SMC6Q12749 LEU2YCL018W 1095 nt9.45□□□□□ -0.9
SMC6Q12749 SUV3YPL029W 2214 nt9.45□□□□□ -0.9
SMC6Q12749 SFL1YOR140W 2301 nt9.45□□□□□ -0.9
SMC6Q12749 YMR265CYMR265C 1386 nt9.43□□□□□ -0.9
SMC6Q12749 RPD3YNL330C 1302 nt9.43□□□□□ -0.9
SMC6Q12749 FSH2YMR222C 672 nt9.43□□□□□ -0.9
SMC6Q12749 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt9.42□□□□□ -0.9
SMC6Q12749 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt9.42□□□□□ -0.9
SMC6Q12749 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt9.42□□□□□ -0.9
SMC6Q12749 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt9.42□□□□□ -0.9
SMC6Q12749 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt9.42□□□□□ -0.9
SMC6Q12749 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt9.42□□□□□ -0.9
SMC6Q12749 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt9.42□□□□□ -0.9
SMC6Q12749 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt9.42□□□□□ -0.9
SMC6Q12749 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt9.42□□□□□ -0.9
SMC6Q12749 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt9.42□□□□□ -0.9
SMC6Q12749 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt9.42□□□□□ -0.9
SMC6Q12749 HAP5YOR358W 729 nt9.42□□□□□ -0.9
SMC6Q12749 snR31snR31 225 nt9.42□□□□□ -0.9
SMC6Q12749 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt9.41□□□□□ -0.9
SMC6Q12749 RPN14YGL004C 1254 nt9.41□□□□□ -0.9
SMC6Q12749 IPL1YPL209C 1104 nt9.41□□□□□ -0.9
SMC6Q12749 MET1YKR069W 1782 nt9.41□□□□□ -0.9
SMC6Q12749 SLG1YOR008C 1137 nt9.4□□□□□ -0.9
SMC6Q12749 SNX3YOR357C 489 nt9.4□□□□□ -0.9
SMC6Q12749 NAM8YHR086W 1572 nt9.4□□□□□ -0.9
SMC6Q12749 SSL2YIL143C 2532 nt9.39□□□□□ -0.91
SMC6Q12749 YOR072WYOR072W 315 nt9.39□□□□□ -0.91
SMC6Q12749 YRF1-2YER190W 5046 nt9.39□□□□□ -0.91
SMC6Q12749 PHB2YGR231C 933 nt9.38□□□□□ -0.91
SMC6Q12749 ADH3YMR083W 1128 nt9.37□□□□□ -0.91
SMC6Q12749 CRC1YOR100C 984 nt9.37□□□□□ -0.91
SMC6Q12749 FLX1YIL134W 936 nt9.36□□□□□ -0.91
SMC6Q12749 YKL053WYKL053W 375 nt9.36□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.8 ms