Protein–RNA interactions for Protein: Q12267

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, yeast

Predictions only

Length 1,418 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SMC4	Q12267	tA(UGC)O	tA(UGC)O	73 nt		13.75	□□□□□ -0.21
SMC4	Q12267	SWM1	YDR260C	513 nt		13.75	□□□□□ -0.21
SMC4	Q12267	FMS1	YMR020W	1527 nt		13.75	□□□□□ -0.21
SMC4	Q12267	TAT2	YOL020W	1779 nt		13.75	□□□□□ -0.21
SMC4	Q12267	HEM13	YDR044W	987 nt		13.73	□□□□□ -0.21
SMC4	Q12267	FCY1	YPR062W	477 nt		13.71	□□□□□ -0.22
SMC4	Q12267	NVJ2	YPR091C	2313 nt		13.7	□□□□□ -0.22
SMC4	Q12267	ZRT3	YKL175W	1512 nt		13.7	□□□□□ -0.22
SMC4	Q12267	CWC15	YDR163W	528 nt		13.69	□□□□□ -0.22
SMC4	Q12267	PHB2	YGR231C	933 nt		13.69	□□□□□ -0.22
SMC4	Q12267	MOB1	YIL106W	945 nt		13.69	□□□□□ -0.22
SMC4	Q12267	YJL067W	YJL067W	351 nt		13.69	□□□□□ -0.22
SMC4	Q12267	THP3	YPR045C	1413 nt		13.67	□□□□□ -0.22
SMC4	Q12267	ERG13	YML126C	1476 nt		13.67	□□□□□ -0.22
SMC4	Q12267	ENO2	YHR174W	1314 nt		13.66	□□□□□ -0.22
SMC4	Q12267	PCP1	YGR101W	1041 nt		13.63	□□□□□ -0.23
SMC4	Q12267	YMR007W	YMR007W	381 nt		13.63	□□□□□ -0.23
SMC4	Q12267	SER2	YGR208W	930 nt		13.62	□□□□□ -0.23
SMC4	Q12267	ASP3-1	YLR155C	1089 nt		13.6	□□□□□ -0.23
SMC4	Q12267	ASP3-2	YLR157C	1089 nt		13.6	□□□□□ -0.23
SMC4	Q12267	ASP3-3	YLR158C	1089 nt		13.6	□□□□□ -0.23
SMC4	Q12267	ASP3-4	YLR160C	1089 nt		13.6	□□□□□ -0.23
SMC4	Q12267	TPC1	YGR096W	945 nt		13.56	□□□□□ -0.24
SMC4	Q12267	BET2	YPR176C	978 nt		13.55	□□□□□ -0.24
SMC4	Q12267	OPI3	YJR073C	621 nt		13.54	□□□□□ -0.24
SMC4	Q12267	HTS1	YPR033C	1641 nt		13.52	□□□□□ -0.24
SMC4	Q12267	GRH1	YDR517W	1119 nt		13.52	□□□□□ -0.25
SMC4	Q12267	RCR1	YBR005W	642 nt		13.52	□□□□□ -0.25
SMC4	Q12267	PAU21	YOR394W	495 nt		13.52	□□□□□ -0.25
SMC4	Q12267	PAU22	YPL282C	495 nt		13.52	□□□□□ -0.25
SMC4	Q12267	TVP23	YDR084C	600 nt		13.51	□□□□□ -0.25
SMC4	Q12267	YKR012C	YKR012C	378 nt		13.51	□□□□□ -0.25
SMC4	Q12267	RRT8	YOL048C	1029 nt		13.51	□□□□□ -0.25
SMC4	Q12267	ACH1	YBL015W	1581 nt		13.49	□□□□□ -0.25
SMC4	Q12267	CYC3	YAL039C	810 nt		13.48	□□□□□ -0.25
SMC4	Q12267	YOR343C	YOR343C	327 nt		13.48	□□□□□ -0.25
SMC4	Q12267	AIM1	YAL046C	357 nt		13.47	□□□□□ -0.25
SMC4	Q12267	DIG1	YPL049C	1359 nt		13.46	□□□□□ -0.26
SMC4	Q12267	FSH2	YMR222C	672 nt		13.45	□□□□□ -0.26
SMC4	Q12267	ALG12	YNR030W	1656 nt		13.44	□□□□□ -0.26
SMC4	Q12267	KAE1	YKR038C	1161 nt		13.44	□□□□□ -0.26
SMC4	Q12267	VPS62	YGR141W	1404 nt		13.43	□□□□□ -0.26
SMC4	Q12267	AMF1	YOR378W	1548 nt		13.42	□□□□□ -0.26
SMC4	Q12267	RPL12B	YDR418W	498 nt		13.41	□□□□□ -0.26
SMC4	Q12267	YNR064C	YNR064C	873 nt		13.4	□□□□□ -0.26
SMC4	Q12267	ERO1	YML130C	1692 nt		13.4	□□□□□ -0.26
SMC4	Q12267	YAL016C-A	YAL016C-A	315 nt		13.39	□□□□□ -0.27
SMC4	Q12267	NAM8	YHR086W	1572 nt		13.39	□□□□□ -0.27
SMC4	Q12267	YGR210C	YGR210C	1236 nt		13.37	□□□□□ -0.27
SMC4	Q12267	YLR280C	YLR280C	351 nt		13.36	□□□□□ -0.27
SMC4	Q12267	HRA1	HRA1	564 nt		13.35	□□□□□ -0.27
SMC4	Q12267	EMC3	YKL207W	762 nt		13.35	□□□□□ -0.27
SMC4	Q12267	SDS24	YBR214W	1584 nt		13.34	□□□□□ -0.27
SMC4	Q12267	ELO1	YJL196C	933 nt		13.34	□□□□□ -0.27
SMC4	Q12267	SRP102	YKL154W	735 nt		13.34	□□□□□ -0.27
SMC4	Q12267	NAR1	YNL240C	1476 nt		13.33	□□□□□ -0.27
SMC4	Q12267	SAC7	YDR389W	1965 nt		13.33	□□□□□ -0.28
SMC4	Q12267	YJL225C	YJL225C	5277 nt		13.31	□□□□□ -0.28
SMC4	Q12267	ENO1	YGR254W	1314 nt		13.31	□□□□□ -0.28
SMC4	Q12267	LEU2	YCL018W	1095 nt		13.3	□□□□□ -0.28
SMC4	Q12267	YDL086W	YDL086W	822 nt		13.29	□□□□□ -0.28
SMC4	Q12267	REX2	YLR059C	810 nt		13.27	□□□□□ -0.29
SMC4	Q12267	MFG1	YDL233W	1377 nt		13.27	□□□□□ -0.29
SMC4	Q12267	PBP1	YGR178C	2169 nt		13.26	□□□□□ -0.29
SMC4	Q12267	YJL160C	YJL160C	864 nt		13.25	□□□□□ -0.29
SMC4	Q12267	CYT2	YKL087C	675 nt		13.25	□□□□□ -0.29
SMC4	Q12267	tL(UAA)B1	tL(UAA)B1	84 nt		13.24	□□□□□ -0.29
SMC4	Q12267	tL(UAA)B2	tL(UAA)B2	84 nt		13.24	□□□□□ -0.29
SMC4	Q12267	tL(UAA)D	tL(UAA)D	84 nt		13.24	□□□□□ -0.29
SMC4	Q12267	SUP51	tL(UAA)J	84 nt		13.24	□□□□□ -0.29
SMC4	Q12267	tL(UAA)K	tL(UAA)K	84 nt		13.24	□□□□□ -0.29
SMC4	Q12267	tL(UAA)L	tL(UAA)L	84 nt		13.24	□□□□□ -0.29
SMC4	Q12267	tL(UAA)N	tL(UAA)N	84 nt		13.24	□□□□□ -0.29
SMC4	Q12267	YOR268C	YOR268C	399 nt		13.24	□□□□□ -0.29
SMC4	Q12267	LSB6	YJL100W	1824 nt		13.23	□□□□□ -0.29
SMC4	Q12267	YMR210W	YMR210W	1350 nt		13.22	□□□□□ -0.29
SMC4	Q12267	PET18	YCR020C	648 nt		13.22	□□□□□ -0.29
SMC4	Q12267	YPL108W	YPL108W	507 nt		13.21	□□□□□ -0.3
SMC4	Q12267	YIL100C-A	YIL100C-A	339 nt		13.19	□□□□□ -0.3
SMC4	Q12267	YLR046C	YLR046C	813 nt		13.18	□□□□□ -0.3
SMC4	Q12267	VBA3	YCL069W	1377 nt		13.18	□□□□□ -0.3
SMC4	Q12267	HOG1	YLR113W	1308 nt		13.16	□□□□□ -0.3
SMC4	Q12267	YMR206W	YMR206W	942 nt		13.16	□□□□□ -0.3
SMC4	Q12267	SWT21	YNL187W	1074 nt		13.15	□□□□□ -0.3
SMC4	Q12267	UTR5	YEL035C	501 nt		13.14	□□□□□ -0.31
SMC4	Q12267	CCT2	YIL142W	1584 nt		13.13	□□□□□ -0.31
SMC4	Q12267	YKL053W	YKL053W	375 nt		13.12	□□□□□ -0.31
SMC4	Q12267	YAT1	YAR035W	2064 nt		13.1	□□□□□ -0.31
SMC4	Q12267	YOR325W	YOR325W	474 nt		13.1	□□□□□ -0.31
SMC4	Q12267	EDC2	YER035W	438 nt		13.08	□□□□□ -0.32
SMC4	Q12267	ENT4	YLL038C	744 nt		13.08	□□□□□ -0.32
SMC4	Q12267	MET1	YKR069W	1782 nt		13.08	□□□□□ -0.32
SMC4	Q12267	SFL1	YOR140W	2301 nt		13.08	□□□□□ -0.32
SMC4	Q12267	MRP1	YDR347W	966 nt		13.07	□□□□□ -0.32
SMC4	Q12267	LSP1	YPL004C	1026 nt		13.07	□□□□□ -0.32
SMC4	Q12267	SDH8	YBR269C	417 nt		13.07	□□□□□ -0.32
SMC4	Q12267	ELP4	YPL101W	1371 nt		13.07	□□□□□ -0.32
SMC4	Q12267	BAP3	YDR046C	1815 nt		13.05	□□□□□ -0.32
SMC4	Q12267	SRP54	YPR088C	1626 nt		13.04	□□□□□ -0.32
SMC4	Q12267	MCH5	YOR306C	1566 nt		13.04	□□□□□ -0.32

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