Protein–RNA interactions for Protein: Q08968

FMP40, UPF0061 protein FMP40, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
FMP40Q08968 YLR173WYLR173W 1827 nt8.19□□□□□ -1.1
FMP40Q08968 GNP1YDR508C 1992 nt8.19□□□□□ -1.1
FMP40Q08968 SOL2YCR073W-A 948 nt8.18□□□□□ -1.1
FMP40Q08968 HEM13YDR044W 987 nt8.18□□□□□ -1.1
FMP40Q08968 ADH7YCR105W 1086 nt8.17□□□□□ -1.1
FMP40Q08968 RAD51YER095W 1203 nt8.17□□□□□ -1.1
FMP40Q08968 LSM5YER146W 282 nt8.17□□□□□ -1.1
FMP40Q08968 NSG2YNL156C 900 nt8.17□□□□□ -1.1
FMP40Q08968 BET2YPR176C 978 nt8.15□□□□□ -1.1
FMP40Q08968 CCT5YJR064W 1689 nt8.14□□□□□ -1.11
FMP40Q08968 DMA2YNL116W 1569 nt8.14□□□□□ -1.11
FMP40Q08968 DDI1YER143W 1287 nt8.14□□□□□ -1.11
FMP40Q08968 CPD1YGR247W 720 nt8.14□□□□□ -1.11
FMP40Q08968 TOM71YHR117W 1920 nt8.13□□□□□ -1.11
FMP40Q08968 PAU15YIR041W 375 nt8.13□□□□□ -1.11
FMP40Q08968 MTO1YGL236C 2010 nt8.12□□□□□ -1.11
FMP40Q08968 MET8YBR213W 825 nt8.12□□□□□ -1.11
FMP40Q08968 DIG1YPL049C 1359 nt8.11□□□□□ -1.11
FMP40Q08968 QDR2YIL121W 1629 nt8.11□□□□□ -1.11
FMP40Q08968 ASP3-1YLR155C 1089 nt8.11□□□□□ -1.11
FMP40Q08968 ASP3-2YLR157C 1089 nt8.11□□□□□ -1.11
FMP40Q08968 ASP3-3YLR158C 1089 nt8.11□□□□□ -1.11
FMP40Q08968 ASP3-4YLR160C 1089 nt8.11□□□□□ -1.11
FMP40Q08968 TMA23YMR269W 636 nt8.11□□□□□ -1.11
FMP40Q08968 TAT2YOL020W 1779 nt8.11□□□□□ -1.11
FMP40Q08968 SNZ1YMR096W 894 nt8.1□□□□□ -1.11
FMP40Q08968 TAF13YML098W 504 nt8.08□□□□□ -1.12
FMP40Q08968 TPN1YGL186C 1740 nt8.08□□□□□ -1.12
FMP40Q08968 SFL1YOR140W 2301 nt8.08□□□□□ -1.12
FMP40Q08968 YDR455CYDR455C 309 nt8.07□□□□□ -1.12
FMP40Q08968 AIM1YAL046C 357 nt8.07□□□□□ -1.12
FMP40Q08968 YPR126CYPR126C 309 nt8.06□□□□□ -1.12
FMP40Q08968 DAK2YFL053W 1776 nt8.06□□□□□ -1.12
FMP40Q08968 IMO32YGR031W 1029 nt8.05□□□□□ -1.12
FMP40Q08968 ALR1YOL130W 2580 nt8.05□□□□□ -1.12
FMP40Q08968 YHR218WYHR218W 1812 nt8.03□□□□□ -1.12
FMP40Q08968 ERG13YML126C 1476 nt8.03□□□□□ -1.12
FMP40Q08968 GID8YMR135C 1368 nt8.03□□□□□ -1.12
FMP40Q08968 IML3YBR107C 738 nt8.03□□□□□ -1.12
FMP40Q08968 SSL2YIL143C 2532 nt8.03□□□□□ -1.12
FMP40Q08968 MDL2YPL270W 2322 nt8.03□□□□□ -1.12
FMP40Q08968 CTI6YPL181W 1521 nt8.03□□□□□ -1.12
FMP40Q08968 RTG2YGL252C 1767 nt8.02□□□□□ -1.13
FMP40Q08968 ADE8YDR408C 645 nt8.02□□□□□ -1.13
FMP40Q08968 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt8.02□□□□□ -1.13
FMP40Q08968 ODC1YPL134C 933 nt8.02□□□□□ -1.13
FMP40Q08968 YDR306CYDR306C 1437 nt8.02□□□□□ -1.13
FMP40Q08968 DUR3YHL016C 2208 nt8.02□□□□□ -1.13
FMP40Q08968 MEX67YPL169C 1800 nt8.01□□□□□ -1.13
FMP40Q08968 THI6YPL214C 1623 nt8□□□□□ -1.13
FMP40Q08968 ENT4YLL038C 744 nt8□□□□□ -1.13
FMP40Q08968 YLR046CYLR046C 813 nt8□□□□□ -1.13
FMP40Q08968 MHF1YOL086W-A 273 nt8□□□□□ -1.13
FMP40Q08968 CWP2YKL096W-A 279 nt7.99□□□□□ -1.13
FMP40Q08968 RRT8YOL048C 1029 nt7.99□□□□□ -1.13
FMP40Q08968 MRS6YOR370C 1812 nt7.99□□□□□ -1.13
FMP40Q08968 POT1YIL160C 1254 nt7.98□□□□□ -1.13
FMP40Q08968 YMR262WYMR262W 942 nt7.98□□□□□ -1.13
FMP40Q08968 YKL133CYKL133C 1392 nt7.97□□□□□ -1.13
FMP40Q08968 SNU66YOR308C 1764 nt7.97□□□□□ -1.13
FMP40Q08968 PAU5YFL020C 369 nt7.97□□□□□ -1.13
FMP40Q08968 YHR219WYHR219W 1875 nt7.97□□□□□ -1.13
FMP40Q08968 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt7.96□□□□□ -1.14
FMP40Q08968 SPS100YHR139C 981 nt7.96□□□□□ -1.14
FMP40Q08968 DLD3YEL071W 1491 nt7.95□□□□□ -1.14
FMP40Q08968 ESS1YJR017C 513 nt7.95□□□□□ -1.14
FMP40Q08968 YJR114WYJR114W 393 nt7.95□□□□□ -1.14
FMP40Q08968 GCD11YER025W 1584 nt7.95□□□□□ -1.14
FMP40Q08968 MDM35YKL053C-A 261 nt7.93□□□□□ -1.14
FMP40Q08968 ADE2YOR128C 1716 nt7.92□□□□□ -1.14
FMP40Q08968 GSF2YML048W 1212 nt7.91□□□□□ -1.14
FMP40Q08968 ABZ2YMR289W 1125 nt7.91□□□□□ -1.14
FMP40Q08968 LPD1YFL018C 1500 nt7.9□□□□□ -1.14
FMP40Q08968 TVP23YDR084C 600 nt7.9□□□□□ -1.14
FMP40Q08968 YNR064CYNR064C 873 nt7.9□□□□□ -1.14
FMP40Q08968 PGC1YPL206C 966 nt7.9□□□□□ -1.14
FMP40Q08968 SAC7YDR389W 1965 nt7.9□□□□□ -1.15
FMP40Q08968 RPD3YNL330C 1302 nt7.89□□□□□ -1.15
FMP40Q08968 OPI3YJR073C 621 nt7.89□□□□□ -1.15
FMP40Q08968 PUS7YOR243C 2031 nt7.88□□□□□ -1.15
FMP40Q08968 ENO2YHR174W 1314 nt7.88□□□□□ -1.15
FMP40Q08968 UFD1YGR048W 1086 nt7.88□□□□□ -1.15
FMP40Q08968 STP3YLR375W 1032 nt7.88□□□□□ -1.15
FMP40Q08968 LSR1LSR1 1175 nt7.88□□□□□ -1.15
FMP40Q08968 TIP1YBR067C 633 nt7.88□□□□□ -1.15
FMP40Q08968 TUB4YLR212C 1422 nt7.87□□□□□ -1.15
FMP40Q08968 APS2YJR058C 444 nt7.87□□□□□ -1.15
FMP40Q08968 ELO1YJL196C 933 nt7.86□□□□□ -1.15
FMP40Q08968 KRE1YNL322C 942 nt7.86□□□□□ -1.15
FMP40Q08968 VMA11YPL234C 495 nt7.86□□□□□ -1.15
FMP40Q08968 ITR2YOL103W 1830 nt7.86□□□□□ -1.15
FMP40Q08968 NBA1YOL070C 1506 nt7.85□□□□□ -1.15
FMP40Q08968 MAM3YOL060C 2121 nt7.85□□□□□ -1.15
FMP40Q08968 HXT10YFL011W 1641 nt7.84□□□□□ -1.15
FMP40Q08968 ADE5,7YGL234W 2409 nt7.83□□□□□ -1.16
FMP40Q08968 KRR1YCL059C 951 nt7.83□□□□□ -1.16
FMP40Q08968 NIF3YGL221C 867 nt7.83□□□□□ -1.16
FMP40Q08968 TIM44YIL022W 1296 nt7.83□□□□□ -1.16
FMP40Q08968 YBR232CYBR232C 360 nt7.83□□□□□ -1.16
FMP40Q08968 PAR32YDL173W 888 nt7.82□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 9.7 ms