Protein–RNA interactions for Protein: Q06625

GDB1, Glycogen debranching enzyme, yeastyeast

Predictions only

Length 1,536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GDB1Q06625 IMO32YGR031W 1029 nt13.02□□□□□ -0.33
GDB1Q06625 PCP1YGR101W 1041 nt13.02□□□□□ -0.33
GDB1Q06625 PET8YNL003C 855 nt13.01□□□□□ -0.33
GDB1Q06625 PAU21YOR394W 495 nt13.01□□□□□ -0.33
GDB1Q06625 PAU22YPL282C 495 nt13.01□□□□□ -0.33
GDB1Q06625 THP3YPR045C 1413 nt13.01□□□□□ -0.33
GDB1Q06625 YPS3YLR121C 1527 nt13□□□□□ -0.33
GDB1Q06625 YDR455CYDR455C 309 nt13□□□□□ -0.33
GDB1Q06625 TAT2YOL020W 1779 nt12.99□□□□□ -0.33
GDB1Q06625 GRH1YDR517W 1119 nt12.98□□□□□ -0.33
GDB1Q06625 MOB1YIL106W 945 nt12.98□□□□□ -0.33
GDB1Q06625 YOR343CYOR343C 327 nt12.98□□□□□ -0.33
GDB1Q06625 HEM13YDR044W 987 nt12.98□□□□□ -0.33
GDB1Q06625 SER2YGR208W 930 nt12.97□□□□□ -0.33
GDB1Q06625 FMS1YMR020W 1527 nt12.97□□□□□ -0.33
GDB1Q06625 RPL12BYDR418W 498 nt12.96□□□□□ -0.33
GDB1Q06625 SPP2YOR148C 558 nt12.94□□□□□ -0.34
GDB1Q06625 KAE1YKR038C 1161 nt12.93□□□□□ -0.34
GDB1Q06625 YJL067WYJL067W 351 nt12.93□□□□□ -0.34
GDB1Q06625 MFG1YDL233W 1377 nt12.92□□□□□ -0.34
GDB1Q06625 RCR1YBR005W 642 nt12.91□□□□□ -0.34
GDB1Q06625 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt12.88□□□□□ -0.35
GDB1Q06625 HTS1YPR033C 1641 nt12.88□□□□□ -0.35
GDB1Q06625 ENO2YHR174W 1314 nt12.87□□□□□ -0.35
GDB1Q06625 ERG13YML126C 1476 nt12.86□□□□□ -0.35
GDB1Q06625 BET2YPR176C 978 nt12.86□□□□□ -0.35
GDB1Q06625 ZRT3YKL175W 1512 nt12.85□□□□□ -0.35
GDB1Q06625 HOG1YLR113W 1308 nt12.84□□□□□ -0.35
GDB1Q06625 YOR268CYOR268C 399 nt12.83□□□□□ -0.35
GDB1Q06625 ACH1YBL015W 1581 nt12.79□□□□□ -0.36
GDB1Q06625 CYC3YAL039C 810 nt12.78□□□□□ -0.36
GDB1Q06625 YMR206WYMR206W 942 nt12.78□□□□□ -0.36
GDB1Q06625 NVJ2YPR091C 2313 nt12.78□□□□□ -0.36
GDB1Q06625 DIG1YPL049C 1359 nt12.78□□□□□ -0.36
GDB1Q06625 CWC15YDR163W 528 nt12.78□□□□□ -0.36
GDB1Q06625 HRA1HRA1 564 nt12.78□□□□□ -0.36
GDB1Q06625 OPI3YJR073C 621 nt12.77□□□□□ -0.37
GDB1Q06625 EMC3YKL207W 762 nt12.77□□□□□ -0.37
GDB1Q06625 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt12.76□□□□□ -0.37
GDB1Q06625 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt12.76□□□□□ -0.37
GDB1Q06625 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt12.76□□□□□ -0.37
GDB1Q06625 SUP51tL(UAA)J 84 nt12.76□□□□□ -0.37
GDB1Q06625 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt12.76□□□□□ -0.37
GDB1Q06625 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt12.76□□□□□ -0.37
GDB1Q06625 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt12.76□□□□□ -0.37
GDB1Q06625 TPC1YGR096W 945 nt12.76□□□□□ -0.37
GDB1Q06625 FSH2YMR222C 672 nt12.76□□□□□ -0.37
GDB1Q06625 ERO1YML130C 1692 nt12.75□□□□□ -0.37
GDB1Q06625 ASP3-1YLR155C 1089 nt12.74□□□□□ -0.37
GDB1Q06625 ASP3-2YLR157C 1089 nt12.74□□□□□ -0.37
GDB1Q06625 ASP3-3YLR158C 1089 nt12.74□□□□□ -0.37
GDB1Q06625 ASP3-4YLR160C 1089 nt12.74□□□□□ -0.37
GDB1Q06625 SRP102YKL154W 735 nt12.73□□□□□ -0.37
GDB1Q06625 YKR012CYKR012C 378 nt12.73□□□□□ -0.37
GDB1Q06625 TVP23YDR084C 600 nt12.72□□□□□ -0.37
GDB1Q06625 TOS1YBR162C 1368 nt12.72□□□□□ -0.37
GDB1Q06625 RRT8YOL048C 1029 nt12.71□□□□□ -0.38
GDB1Q06625 YGR210CYGR210C 1236 nt12.69□□□□□ -0.38
GDB1Q06625 SDS24YBR214W 1584 nt12.68□□□□□ -0.38
GDB1Q06625 NAM8YHR086W 1572 nt12.67□□□□□ -0.38
GDB1Q06625 YJL160CYJL160C 864 nt12.67□□□□□ -0.38
GDB1Q06625 YNR064CYNR064C 873 nt12.67□□□□□ -0.38
GDB1Q06625 EDC2YER035W 438 nt12.66□□□□□ -0.38
GDB1Q06625 AIM1YAL046C 357 nt12.66□□□□□ -0.38
GDB1Q06625 PET18YCR020C 648 nt12.65□□□□□ -0.38
GDB1Q06625 YLR280CYLR280C 351 nt12.65□□□□□ -0.38
GDB1Q06625 ALG12YNR030W 1656 nt12.65□□□□□ -0.39
GDB1Q06625 AMF1YOR378W 1548 nt12.64□□□□□ -0.39
GDB1Q06625 YMR210WYMR210W 1350 nt12.64□□□□□ -0.39
GDB1Q06625 NAR1YNL240C 1476 nt12.61□□□□□ -0.39
GDB1Q06625 SAC7YDR389W 1965 nt12.61□□□□□ -0.39
GDB1Q06625 REX2YLR059C 810 nt12.61□□□□□ -0.39
GDB1Q06625 SDH8YBR269C 417 nt12.6□□□□□ -0.39
GDB1Q06625 ENO1YGR254W 1314 nt12.6□□□□□ -0.39
GDB1Q06625 PBP1YGR178C 2169 nt12.6□□□□□ -0.39
GDB1Q06625 BAP3YDR046C 1815 nt12.58□□□□□ -0.4
GDB1Q06625 ELP4YPL101W 1371 nt12.57□□□□□ -0.4
GDB1Q06625 YPL108WYPL108W 507 nt12.57□□□□□ -0.4
GDB1Q06625 UTR5YEL035C 501 nt12.57□□□□□ -0.4
GDB1Q06625 ELO1YJL196C 933 nt12.57□□□□□ -0.4
GDB1Q06625 PRE5YMR314W 705 nt12.55□□□□□ -0.4
GDB1Q06625 YPL247CYPL247C 1572 nt12.54□□□□□ -0.4
GDB1Q06625 LEU2YCL018W 1095 nt12.54□□□□□ -0.4
GDB1Q06625 YAT1YAR035W 2064 nt12.52□□□□□ -0.4
GDB1Q06625 VPS62YGR141W 1404 nt12.52□□□□□ -0.4
GDB1Q06625 MCH5YOR306C 1566 nt12.5□□□□□ -0.41
GDB1Q06625 MRP1YDR347W 966 nt12.48□□□□□ -0.41
GDB1Q06625 VBA3YCL069W 1377 nt12.48□□□□□ -0.41
GDB1Q06625 ADA2YDR448W 1305 nt12.47□□□□□ -0.41
GDB1Q06625 LSB6YJL100W 1824 nt12.46□□□□□ -0.41
GDB1Q06625 YDL086WYDL086W 822 nt12.42□□□□□ -0.42
GDB1Q06625 CYT2YKL087C 675 nt12.42□□□□□ -0.42
GDB1Q06625 SWT21YNL187W 1074 nt12.42□□□□□ -0.42
GDB1Q06625 YOR325WYOR325W 474 nt12.42□□□□□ -0.42
GDB1Q06625 YJR149WYJR149W 1215 nt12.4□□□□□ -0.42
GDB1Q06625 LSP1YPL004C 1026 nt12.4□□□□□ -0.42
GDB1Q06625 SFL1YOR140W 2301 nt12.39□□□□□ -0.43
GDB1Q06625 RDN25-1RDN25-1 3396 nt12.39□□□□□ -0.43
GDB1Q06625 RDN25-2RDN25-2 3396 nt12.39□□□□□ -0.43
GDB1Q06625 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 70.3 ms