Protein–RNA interactions for Protein: Q06410

ATG17, Autophagy-related protein 17, yeastyeast

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG17Q06410 RPL4AYBR031W 1089 nt8.54□□□□□ -1.04
ATG17Q06410 SNX3YOR357C 489 nt8.54□□□□□ -1.04
ATG17Q06410 TAT2YOL020W 1779 nt8.53□□□□□ -1.04
ATG17Q06410 YCR087WYCR087W 516 nt8.52□□□□□ -1.05
ATG17Q06410 GPN2YOR262W 1044 nt8.52□□□□□ -1.05
ATG17Q06410 ORT1YOR130C 879 nt8.51□□□□□ -1.05
ATG17Q06410 NPP2YEL016C 1482 nt8.51□□□□□ -1.05
ATG17Q06410 SOL2YCR073W-A 948 nt8.5□□□□□ -1.05
ATG17Q06410 YSR3YKR053C 1215 nt8.5□□□□□ -1.05
ATG17Q06410 DUR3YHL016C 2208 nt8.5□□□□□ -1.05
ATG17Q06410 TOM71YHR117W 1920 nt8.5□□□□□ -1.05
ATG17Q06410 THI74YDR438W 1113 nt8.49□□□□□ -1.05
ATG17Q06410 PAU16YKL224C 372 nt8.49□□□□□ -1.05
ATG17Q06410 FRA1YLL029W 2250 nt8.48□□□□□ -1.05
ATG17Q06410 YIL177CYIL177C 5277 nt8.47□□□□□ -1.05
ATG17Q06410 YDR467CYDR467C 327 nt8.47□□□□□ -1.05
ATG17Q06410 RAS2YNL098C 969 nt8.47□□□□□ -1.05
ATG17Q06410 LPD1YFL018C 1500 nt8.47□□□□□ -1.05
ATG17Q06410 APT2YDR441C 546 nt8.46□□□□□ -1.06
ATG17Q06410 RPS14BYJL191W 417 nt8.46□□□□□ -1.06
ATG17Q06410 ALR1YOL130W 2580 nt8.45□□□□□ -1.06
ATG17Q06410 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt8.44□□□□□ -1.06
ATG17Q06410 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt8.44□□□□□ -1.06
ATG17Q06410 POP2YNR052C 1302 nt8.44□□□□□ -1.06
ATG17Q06410 DUS3YLR401C 2007 nt8.43□□□□□ -1.06
ATG17Q06410 NUC1YJL208C 990 nt8.43□□□□□ -1.06
ATG17Q06410 snR4snR4 186 nt8.43□□□□□ -1.06
ATG17Q06410 TRP2YER090W 1524 nt8.43□□□□□ -1.06
ATG17Q06410 ADE16YLR028C 1776 nt8.43□□□□□ -1.06
ATG17Q06410 NAT4YMR069W 858 nt8.42□□□□□ -1.06
ATG17Q06410 THI6YPL214C 1623 nt8.4□□□□□ -1.06
ATG17Q06410 HXT11YOL156W 1704 nt8.4□□□□□ -1.07
ATG17Q06410 GND1YHR183W 1470 nt8.39□□□□□ -1.07
ATG17Q06410 HXT12YIL170W 1374 nt8.39□□□□□ -1.07
ATG17Q06410 SFL1YOR140W 2301 nt8.39□□□□□ -1.07
ATG17Q06410 YDR455CYDR455C 309 nt8.39□□□□□ -1.07
ATG17Q06410 EMC3YKL207W 762 nt8.37□□□□□ -1.07
ATG17Q06410 XYL2YLR070C 1071 nt8.36□□□□□ -1.07
ATG17Q06410 AIM45YPR004C 1035 nt8.36□□□□□ -1.07
ATG17Q06410 YMR265CYMR265C 1386 nt8.35□□□□□ -1.07
ATG17Q06410 ERG13YML126C 1476 nt8.35□□□□□ -1.07
ATG17Q06410 CSM1YCR086W 573 nt8.35□□□□□ -1.07
ATG17Q06410 YGL034CYGL034C 366 nt8.35□□□□□ -1.07
ATG17Q06410 FCY21YER060W 1587 nt8.35□□□□□ -1.07
ATG17Q06410 YRF1-1YDR545W 5391 nt8.34□□□□□ -1.07
ATG17Q06410 YRF1-5YLR467W 5391 nt8.34□□□□□ -1.07
ATG17Q06410 YRF1-8YOR396W 5391 nt8.34□□□□□ -1.07
ATG17Q06410 TSC10YBR265W 963 nt8.34□□□□□ -1.07
ATG17Q06410 RPN14YGL004C 1254 nt8.33□□□□□ -1.08
ATG17Q06410 YLR279WYLR279W 390 nt8.33□□□□□ -1.08
ATG17Q06410 NSG2YNL156C 900 nt8.33□□□□□ -1.08
ATG17Q06410 YBL095WYBL095W 813 nt8.33□□□□□ -1.08
ATG17Q06410 EAF3YPR023C 1206 nt8.33□□□□□ -1.08
ATG17Q06410 PFS2YNL317W 1398 nt8.33□□□□□ -1.08
ATG17Q06410 YRF1-3YGR296W 5580 nt8.32□□□□□ -1.08
ATG17Q06410 YRF1-6YNL339C 5580 nt8.32□□□□□ -1.08
ATG17Q06410 YRF1-7YPL283C 5580 nt8.32□□□□□ -1.08
ATG17Q06410 SAC7YDR389W 1965 nt8.32□□□□□ -1.08
ATG17Q06410 LOT5YKL183W 921 nt8.32□□□□□ -1.08
ATG17Q06410 MCM5YLR274W 2328 nt8.32□□□□□ -1.08
ATG17Q06410 SRM1YGL097W 1449 nt8.31□□□□□ -1.08
ATG17Q06410 OYE2YHR179W 1203 nt8.31□□□□□ -1.08
ATG17Q06410 HAP5YOR358W 729 nt8.3□□□□□ -1.08
ATG17Q06410 MET30YIL046W 1923 nt8.3□□□□□ -1.08
ATG17Q06410 AAT1YKL106W 1356 nt8.3□□□□□ -1.08
ATG17Q06410 ELO1YJL196C 933 nt8.29□□□□□ -1.08
ATG17Q06410 GPM1YKL152C 744 nt8.29□□□□□ -1.08
ATG17Q06410 YMR210WYMR210W 1350 nt8.29□□□□□ -1.08
ATG17Q06410 DIA4YHR011W 1341 nt8.29□□□□□ -1.08
ATG17Q06410 YNL190WYNL190W 615 nt8.28□□□□□ -1.08
ATG17Q06410 YMC2YBR104W 990 nt8.28□□□□□ -1.08
ATG17Q06410 FTH1YBR207W 1398 nt8.27□□□□□ -1.09
ATG17Q06410 HSV2YGR223C 1347 nt8.27□□□□□ -1.09
ATG17Q06410 MSB4YOL112W 1479 nt8.26□□□□□ -1.09
ATG17Q06410 RPT5YOR117W 1305 nt8.26□□□□□ -1.09
ATG17Q06410 YNR064CYNR064C 873 nt8.24□□□□□ -1.09
ATG17Q06410 MDH2YOL126C 1134 nt8.24□□□□□ -1.09
ATG17Q06410 SLM3YDL033C 1254 nt8.23□□□□□ -1.09
ATG17Q06410 PRY1YJL079C 900 nt8.23□□□□□ -1.09
ATG17Q06410 SAM3YPL274W 1764 nt8.22□□□□□ -1.09
ATG17Q06410 KEL3YPL263C 1956 nt8.22□□□□□ -1.09
ATG17Q06410 SUV3YPL029W 2214 nt8.22□□□□□ -1.09
ATG17Q06410 DDI1YER143W 1287 nt8.22□□□□□ -1.09
ATG17Q06410 TPS1YBR126C 1488 nt8.21□□□□□ -1.09
ATG17Q06410 RRT8YOL048C 1029 nt8.21□□□□□ -1.1
ATG17Q06410 YLR173WYLR173W 1827 nt8.21□□□□□ -1.1
ATG17Q06410 YGR012WYGR012W 1182 nt8.19□□□□□ -1.1
ATG17Q06410 snR31snR31 225 nt8.18□□□□□ -1.1
ATG17Q06410 RTG2YGL252C 1767 nt8.17□□□□□ -1.1
ATG17Q06410 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt8.17□□□□□ -1.1
ATG17Q06410 AIM34YMR003W 597 nt8.17□□□□□ -1.1
ATG17Q06410 TMA23YMR269W 636 nt8.17□□□□□ -1.1
ATG17Q06410 LEA1YPL213W 717 nt8.17□□□□□ -1.1
ATG17Q06410 CRC1YOR100C 984 nt8.16□□□□□ -1.1
ATG17Q06410 LAS17YOR181W 1902 nt8.16□□□□□ -1.1
ATG17Q06410 YLR072WYLR072W 2082 nt8.15□□□□□ -1.1
ATG17Q06410 YJL118WYJL118W 660 nt8.15□□□□□ -1.1
ATG17Q06410 YJR114WYJR114W 393 nt8.15□□□□□ -1.1
ATG17Q06410 MRS4YKR052C 915 nt8.15□□□□□ -1.1
ATG17Q06410 SDH5YOL071W 489 nt8.14□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19.4 ms