Protein–RNA interactions for Protein: Q03954

SPC19, DASH complex subunit SPC19, yeastyeast

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPC19Q03954 UGP1YKL035W 1500 nt8.16□□□□□ -1.1
SPC19Q03954 ASP3-1YLR155C 1089 nt8.16□□□□□ -1.1
SPC19Q03954 ASP3-2YLR157C 1089 nt8.16□□□□□ -1.1
SPC19Q03954 ASP3-3YLR158C 1089 nt8.16□□□□□ -1.1
SPC19Q03954 ASP3-4YLR160C 1089 nt8.16□□□□□ -1.1
SPC19Q03954 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt8.16□□□□□ -1.1
SPC19Q03954 GCD11YER025W 1584 nt8.15□□□□□ -1.1
SPC19Q03954 AIM1YAL046C 357 nt8.15□□□□□ -1.1
SPC19Q03954 CAB5YDR196C 726 nt8.14□□□□□ -1.11
SPC19Q03954 YJL118WYJL118W 660 nt8.14□□□□□ -1.11
SPC19Q03954 ENT4YLL038C 744 nt8.14□□□□□ -1.11
SPC19Q03954 YLR046CYLR046C 813 nt8.14□□□□□ -1.11
SPC19Q03954 GPN2YOR262W 1044 nt8.14□□□□□ -1.11
SPC19Q03954 RIB7YBR153W 735 nt8.14□□□□□ -1.11
SPC19Q03954 GID8YMR135C 1368 nt8.13□□□□□ -1.11
SPC19Q03954 YPI1YFR003C 468 nt8.13□□□□□ -1.11
SPC19Q03954 RBG2YGR173W 1107 nt8.13□□□□□ -1.11
SPC19Q03954 LSM5YER146W 282 nt8.12□□□□□ -1.11
SPC19Q03954 YJL055WYJL055W 738 nt8.12□□□□□ -1.11
SPC19Q03954 ACO2YJL200C 2370 nt8.12□□□□□ -1.11
SPC19Q03954 EAF3YPR023C 1206 nt8.1□□□□□ -1.11
SPC19Q03954 YRF1-3YGR296W 5580 nt8.09□□□□□ -1.11
SPC19Q03954 YRF1-6YNL339C 5580 nt8.09□□□□□ -1.11
SPC19Q03954 YRF1-7YPL283C 5580 nt8.09□□□□□ -1.11
SPC19Q03954 PSD1YNL169C 1503 nt8.09□□□□□ -1.11
SPC19Q03954 HXT12YIL170W 1374 nt8.09□□□□□ -1.12
SPC19Q03954 TPS1YBR126C 1488 nt8.08□□□□□ -1.12
SPC19Q03954 YKR023WYKR023W 1593 nt8.08□□□□□ -1.12
SPC19Q03954 YKL133CYKL133C 1392 nt8.08□□□□□ -1.12
SPC19Q03954 SAM3YPL274W 1764 nt8.07□□□□□ -1.12
SPC19Q03954 TAT2YOL020W 1779 nt8.06□□□□□ -1.12
SPC19Q03954 SSL2YIL143C 2532 nt8.06□□□□□ -1.12
SPC19Q03954 RIB2YOL066C 1776 nt8.05□□□□□ -1.12
SPC19Q03954 BIM1YER016W 1035 nt8.04□□□□□ -1.12
SPC19Q03954 TIP1YBR067C 633 nt8.04□□□□□ -1.12
SPC19Q03954 MRS6YOR370C 1812 nt8.03□□□□□ -1.12
SPC19Q03954 DDI1YER143W 1287 nt8.03□□□□□ -1.12
SPC19Q03954 ERG13YML126C 1476 nt8.01□□□□□ -1.13
SPC19Q03954 TIM44YIL022W 1296 nt8.01□□□□□ -1.13
SPC19Q03954 SFL1YOR140W 2301 nt8.01□□□□□ -1.13
SPC19Q03954 DMA2YNL116W 1569 nt8.01□□□□□ -1.13
SPC19Q03954 RPD3YNL330C 1302 nt8.01□□□□□ -1.13
SPC19Q03954 ZAP1YJL056C 2643 nt8□□□□□ -1.13
SPC19Q03954 DLD3YEL071W 1491 nt8□□□□□ -1.13
SPC19Q03954 ODC1YPL134C 933 nt8□□□□□ -1.13
SPC19Q03954 GAL3YDR009W 1563 nt7.99□□□□□ -1.13
SPC19Q03954 YDR455CYDR455C 309 nt7.99□□□□□ -1.13
SPC19Q03954 TMA23YMR269W 636 nt7.99□□□□□ -1.13
SPC19Q03954 LSR1LSR1 1175 nt7.98□□□□□ -1.13
SPC19Q03954 VMA11YPL234C 495 nt7.98□□□□□ -1.13
SPC19Q03954 GUT1YHL032C 2130 nt7.97□□□□□ -1.13
SPC19Q03954 YPL041CYPL041C 624 nt7.97□□□□□ -1.13
SPC19Q03954 YHL008CYHL008C 1884 nt7.96□□□□□ -1.13
SPC19Q03954 YHR219WYHR219W 1875 nt7.96□□□□□ -1.13
SPC19Q03954 ADE8YDR408C 645 nt7.96□□□□□ -1.14
SPC19Q03954 YNR029CYNR029C 1290 nt7.96□□□□□ -1.14
SPC19Q03954 CWP2YKL096W-A 279 nt7.95□□□□□ -1.14
SPC19Q03954 UBP13YBL067C 2244 nt7.94□□□□□ -1.14
SPC19Q03954 IMO32YGR031W 1029 nt7.94□□□□□ -1.14
SPC19Q03954 RRT8YOL048C 1029 nt7.94□□□□□ -1.14
SPC19Q03954 ADH1YOL086C 1047 nt7.94□□□□□ -1.14
SPC19Q03954 SGV1YPR161C 1974 nt7.93□□□□□ -1.14
SPC19Q03954 MDM35YKL053C-A 261 nt7.93□□□□□ -1.14
SPC19Q03954 ITR2YOL103W 1830 nt7.93□□□□□ -1.14
SPC19Q03954 YJR114WYJR114W 393 nt7.92□□□□□ -1.14
SPC19Q03954 YOR300WYOR300W 309 nt7.92□□□□□ -1.14
SPC19Q03954 YNR064CYNR064C 873 nt7.91□□□□□ -1.14
SPC19Q03954 SNX3YOR357C 489 nt7.91□□□□□ -1.14
SPC19Q03954 HXK1YFR053C 1458 nt7.9□□□□□ -1.14
SPC19Q03954 YMR262WYMR262W 942 nt7.9□□□□□ -1.14
SPC19Q03954 DUR3YHL016C 2208 nt7.9□□□□□ -1.15
SPC19Q03954 KRR1YCL059C 951 nt7.88□□□□□ -1.15
SPC19Q03954 RPN14YGL004C 1254 nt7.88□□□□□ -1.15
SPC19Q03954 YHC3YJL059W 1227 nt7.88□□□□□ -1.15
SPC19Q03954 ELO1YJL196C 933 nt7.88□□□□□ -1.15
SPC19Q03954 DAK2YFL053W 1776 nt7.87□□□□□ -1.15
SPC19Q03954 DAL7YIR031C 1665 nt7.86□□□□□ -1.15
SPC19Q03954 YJL195CYJL195C 702 nt7.86□□□□□ -1.15
SPC19Q03954 HDA1YNL021W 2121 nt7.86□□□□□ -1.15
SPC19Q03954 RPC31YNL151C 756 nt7.86□□□□□ -1.15
SPC19Q03954 SAC7YDR389W 1965 nt7.86□□□□□ -1.15
SPC19Q03954 YHR218WYHR218W 1812 nt7.85□□□□□ -1.15
SPC19Q03954 YMR265CYMR265C 1386 nt7.84□□□□□ -1.15
SPC19Q03954 ALD5YER073W 1563 nt7.84□□□□□ -1.15
SPC19Q03954 ECM10YEL030W 1935 nt7.84□□□□□ -1.15
SPC19Q03954 YOR072WYOR072W 315 nt7.84□□□□□ -1.15
SPC19Q03954 IML3YBR107C 738 nt7.84□□□□□ -1.15
SPC19Q03954 CCT5YJR064W 1689 nt7.83□□□□□ -1.16
SPC19Q03954 KEL3YPL263C 1956 nt7.83□□□□□ -1.16
SPC19Q03954 IDP3YNL009W 1263 nt7.83□□□□□ -1.16
SPC19Q03954 HAP5YOR358W 729 nt7.83□□□□□ -1.16
SPC19Q03954 snR31snR31 225 nt7.83□□□□□ -1.16
SPC19Q03954 INH1YDL181W 258 nt7.82□□□□□ -1.16
SPC19Q03954 PCP1YGR101W 1041 nt7.82□□□□□ -1.16
SPC19Q03954 DPH5YLR172C 903 nt7.82□□□□□ -1.16
SPC19Q03954 SPS100YHR139C 981 nt7.81□□□□□ -1.16
SPC19Q03954 YPR126CYPR126C 309 nt7.81□□□□□ -1.16
SPC19Q03954 ENO2YHR174W 1314 nt7.8□□□□□ -1.16
SPC19Q03954 MTO1YGL236C 2010 nt7.8□□□□□ -1.16
SPC19Q03954 RIM2YBR192W 1134 nt7.8□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 10.1 ms