Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CBX1P83916 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CBX1P83916 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CBX1P83916 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CBX1P83916 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CBX1P83916 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CBX1P83916 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CBX1P83916 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CBX1P83916 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CBX1P83916 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CBX1P83916 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CBX1P83916 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CBX1P83916 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CBX1P83916 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CBX1P83916 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CBX1P83916 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CBX1P83916 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CBX1P83916 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CBX1P83916 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CBX1P83916 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CBX1P83916 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CBX1P83916 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CBX1P83916 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CBX1P83916 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CBX1P83916 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CBX1P83916 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CBX1P83916 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CBX1P83916 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CBX1P83916 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CBX1P83916 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CBX1P83916 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CBX1P83916 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CBX1P83916 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CBX1P83916 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CBX1P83916 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CBX1P83916 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CBX1P83916 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CBX1P83916 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CBX1P83916 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CBX1P83916 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CBX1P83916 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CBX1P83916 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CBX1P83916 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CBX1P83916 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CBX1P83916 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CBX1P83916 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CBX1P83916 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CBX1P83916 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CBX1P83916 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CBX1P83916 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CBX1P83916 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CBX1P83916 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CBX1P83916 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CBX1P83916 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CBX1P83916 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CBX1P83916 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CBX1P83916 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CBX1P83916 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CBX1P83916 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CBX1P83916 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CBX1P83916 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CBX1P83916 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CBX1P83916 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CBX1P83916 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CBX1P83916 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CBX1P83916 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CBX1P83916 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CBX1P83916 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CBX1P83916 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CBX1P83916 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CBX1P83916 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
CBX1P83916 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CBX1P83916 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CBX1P83916 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CBX1P83916 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CBX1P83916 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CBX1P83916 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CBX1P83916 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CBX1P83916 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CBX1P83916 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CBX1P83916 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CBX1P83916 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CBX1P83916 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CBX1P83916 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CBX1P83916 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CBX1P83916 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CBX1P83916 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CBX1P83916 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CBX1P83916 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CBX1P83916 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CBX1P83916 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CBX1P83916 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CBX1P83916 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CBX1P83916 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CBX1P83916 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CBX1P83916 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CBX1P83916 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CBX1P83916 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CBX1P83916 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CBX1P83916 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms