Protein–RNA interactions for Protein: P78329

CYP4F2, Phylloquinone omega-hydroxylase CYP4F2, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F2P78329 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CYP4F2P78329 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYP4F2P78329 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYP4F2P78329 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYP4F2P78329 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYP4F2P78329 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYP4F2P78329 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYP4F2P78329 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYP4F2P78329 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYP4F2P78329 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYP4F2P78329 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYP4F2P78329 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYP4F2P78329 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYP4F2P78329 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYP4F2P78329 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYP4F2P78329 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CYP4F2P78329 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CYP4F2P78329 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYP4F2P78329 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYP4F2P78329 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYP4F2P78329 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CYP4F2P78329 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CYP4F2P78329 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CYP4F2P78329 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CYP4F2P78329 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CYP4F2P78329 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYP4F2P78329 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYP4F2P78329 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYP4F2P78329 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYP4F2P78329 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYP4F2P78329 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CYP4F2P78329 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYP4F2P78329 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CYP4F2P78329 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYP4F2P78329 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYP4F2P78329 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYP4F2P78329 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CYP4F2P78329 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CYP4F2P78329 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CYP4F2P78329 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYP4F2P78329 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYP4F2P78329 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYP4F2P78329 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYP4F2P78329 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYP4F2P78329 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYP4F2P78329 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYP4F2P78329 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYP4F2P78329 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYP4F2P78329 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYP4F2P78329 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYP4F2P78329 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYP4F2P78329 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CYP4F2P78329 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CYP4F2P78329 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CYP4F2P78329 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CYP4F2P78329 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CYP4F2P78329 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CYP4F2P78329 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CYP4F2P78329 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYP4F2P78329 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYP4F2P78329 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYP4F2P78329 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYP4F2P78329 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CYP4F2P78329 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYP4F2P78329 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYP4F2P78329 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CYP4F2P78329 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYP4F2P78329 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYP4F2P78329 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYP4F2P78329 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYP4F2P78329 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYP4F2P78329 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYP4F2P78329 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYP4F2P78329 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYP4F2P78329 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYP4F2P78329 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYP4F2P78329 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYP4F2P78329 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYP4F2P78329 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP4F2P78329 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP4F2P78329 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP4F2P78329 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP4F2P78329 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP4F2P78329 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP4F2P78329 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP4F2P78329 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP4F2P78329 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP4F2P78329 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP4F2P78329 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP4F2P78329 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP4F2P78329 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP4F2P78329 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP4F2P78329 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP4F2P78329 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP4F2P78329 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP4F2P78329 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP4F2P78329 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP4F2P78329 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP4F2P78329 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP4F2P78329 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms