Protein–RNA interactions for Protein: P60983

GMFB, Glia maturation factor beta, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMFBP60983 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GMFBP60983 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GMFBP60983 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GMFBP60983 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GMFBP60983 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GMFBP60983 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GMFBP60983 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GMFBP60983 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GMFBP60983 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GMFBP60983 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GMFBP60983 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GMFBP60983 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GMFBP60983 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GMFBP60983 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GMFBP60983 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GMFBP60983 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GMFBP60983 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GMFBP60983 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GMFBP60983 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GMFBP60983 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GMFBP60983 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GMFBP60983 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GMFBP60983 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GMFBP60983 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GMFBP60983 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GMFBP60983 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GMFBP60983 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GMFBP60983 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GMFBP60983 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GMFBP60983 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GMFBP60983 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GMFBP60983 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GMFBP60983 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GMFBP60983 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GMFBP60983 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GMFBP60983 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GMFBP60983 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GMFBP60983 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GMFBP60983 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GMFBP60983 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GMFBP60983 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GMFBP60983 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GMFBP60983 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GMFBP60983 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GMFBP60983 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GMFBP60983 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GMFBP60983 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GMFBP60983 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GMFBP60983 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GMFBP60983 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GMFBP60983 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GMFBP60983 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GMFBP60983 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GMFBP60983 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GMFBP60983 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GMFBP60983 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GMFBP60983 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GMFBP60983 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GMFBP60983 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GMFBP60983 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GMFBP60983 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GMFBP60983 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GMFBP60983 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GMFBP60983 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GMFBP60983 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GMFBP60983 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GMFBP60983 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GMFBP60983 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GMFBP60983 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GMFBP60983 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GMFBP60983 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GMFBP60983 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GMFBP60983 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GMFBP60983 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GMFBP60983 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GMFBP60983 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GMFBP60983 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GMFBP60983 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GMFBP60983 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GMFBP60983 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GMFBP60983 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GMFBP60983 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GMFBP60983 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GMFBP60983 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GMFBP60983 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GMFBP60983 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GMFBP60983 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GMFBP60983 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GMFBP60983 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GMFBP60983 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GMFBP60983 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GMFBP60983 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GMFBP60983 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GMFBP60983 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GMFBP60983 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GMFBP60983 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GMFBP60983 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GMFBP60983 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GMFBP60983 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GMFBP60983 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms