Protein–RNA interactions for Protein: P58294

PROK1, Prokineticin-1, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROK1P58294 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PROK1P58294 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PROK1P58294 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PROK1P58294 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PROK1P58294 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PROK1P58294 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PROK1P58294 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PROK1P58294 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PROK1P58294 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PROK1P58294 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PROK1P58294 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PROK1P58294 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PROK1P58294 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PROK1P58294 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PROK1P58294 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PROK1P58294 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PROK1P58294 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PROK1P58294 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PROK1P58294 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PROK1P58294 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PROK1P58294 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PROK1P58294 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PROK1P58294 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PROK1P58294 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PROK1P58294 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PROK1P58294 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PROK1P58294 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PROK1P58294 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PROK1P58294 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PROK1P58294 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PROK1P58294 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PROK1P58294 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PROK1P58294 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PROK1P58294 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PROK1P58294 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PROK1P58294 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PROK1P58294 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PROK1P58294 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PROK1P58294 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PROK1P58294 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PROK1P58294 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PROK1P58294 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PROK1P58294 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PROK1P58294 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PROK1P58294 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PROK1P58294 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PROK1P58294 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PROK1P58294 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PROK1P58294 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PROK1P58294 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PROK1P58294 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PROK1P58294 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PROK1P58294 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PROK1P58294 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PROK1P58294 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PROK1P58294 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PROK1P58294 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PROK1P58294 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PROK1P58294 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PROK1P58294 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PROK1P58294 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PROK1P58294 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PROK1P58294 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PROK1P58294 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PROK1P58294 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PROK1P58294 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PROK1P58294 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PROK1P58294 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PROK1P58294 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PROK1P58294 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PROK1P58294 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PROK1P58294 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PROK1P58294 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PROK1P58294 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PROK1P58294 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PROK1P58294 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PROK1P58294 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PROK1P58294 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PROK1P58294 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PROK1P58294 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PROK1P58294 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PROK1P58294 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PROK1P58294 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PROK1P58294 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PROK1P58294 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PROK1P58294 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PROK1P58294 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PROK1P58294 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PROK1P58294 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PROK1P58294 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PROK1P58294 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PROK1P58294 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PROK1P58294 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PROK1P58294 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PROK1P58294 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PROK1P58294 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PROK1P58294 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PROK1P58294 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PROK1P58294 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PROK1P58294 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms