Protein–RNA interactions for Protein: P57088

TMEM33, Transmembrane protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM33P57088 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM33P57088 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM33P57088 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM33P57088 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM33P57088 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM33P57088 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM33P57088 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM33P57088 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM33P57088 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM33P57088 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM33P57088 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM33P57088 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM33P57088 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM33P57088 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM33P57088 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM33P57088 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM33P57088 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM33P57088 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM33P57088 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM33P57088 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM33P57088 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM33P57088 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM33P57088 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM33P57088 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM33P57088 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM33P57088 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM33P57088 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM33P57088 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM33P57088 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM33P57088 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM33P57088 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM33P57088 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM33P57088 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM33P57088 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM33P57088 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM33P57088 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM33P57088 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM33P57088 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM33P57088 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM33P57088 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM33P57088 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM33P57088 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM33P57088 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM33P57088 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM33P57088 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM33P57088 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM33P57088 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM33P57088 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM33P57088 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM33P57088 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM33P57088 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM33P57088 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM33P57088 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM33P57088 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM33P57088 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM33P57088 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM33P57088 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM33P57088 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM33P57088 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM33P57088 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM33P57088 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM33P57088 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM33P57088 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM33P57088 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM33P57088 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM33P57088 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM33P57088 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM33P57088 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM33P57088 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM33P57088 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM33P57088 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM33P57088 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM33P57088 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM33P57088 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM33P57088 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TMEM33P57088 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM33P57088 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM33P57088 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM33P57088 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM33P57088 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM33P57088 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM33P57088 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM33P57088 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM33P57088 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM33P57088 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM33P57088 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM33P57088 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM33P57088 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM33P57088 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM33P57088 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM33P57088 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM33P57088 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM33P57088 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM33P57088 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM33P57088 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM33P57088 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM33P57088 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM33P57088 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM33P57088 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM33P57088 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms