Protein–RNA interactions for Protein: P53985

SLC16A1, Monocarboxylate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC16A1P53985 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC16A1P53985 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC16A1P53985 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC16A1P53985 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC16A1P53985 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC16A1P53985 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC16A1P53985 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC16A1P53985 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC16A1P53985 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC16A1P53985 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC16A1P53985 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC16A1P53985 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC16A1P53985 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC16A1P53985 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC16A1P53985 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC16A1P53985 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC16A1P53985 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC16A1P53985 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC16A1P53985 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC16A1P53985 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC16A1P53985 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC16A1P53985 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC16A1P53985 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC16A1P53985 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC16A1P53985 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC16A1P53985 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC16A1P53985 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC16A1P53985 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC16A1P53985 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC16A1P53985 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC16A1P53985 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC16A1P53985 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC16A1P53985 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC16A1P53985 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC16A1P53985 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC16A1P53985 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC16A1P53985 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC16A1P53985 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC16A1P53985 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC16A1P53985 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC16A1P53985 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC16A1P53985 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC16A1P53985 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC16A1P53985 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC16A1P53985 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC16A1P53985 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC16A1P53985 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC16A1P53985 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC16A1P53985 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC16A1P53985 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC16A1P53985 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC16A1P53985 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC16A1P53985 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC16A1P53985 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC16A1P53985 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC16A1P53985 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC16A1P53985 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC16A1P53985 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC16A1P53985 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC16A1P53985 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC16A1P53985 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC16A1P53985 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC16A1P53985 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC16A1P53985 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC16A1P53985 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC16A1P53985 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC16A1P53985 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC16A1P53985 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC16A1P53985 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC16A1P53985 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC16A1P53985 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC16A1P53985 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC16A1P53985 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC16A1P53985 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC16A1P53985 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC16A1P53985 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC16A1P53985 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC16A1P53985 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC16A1P53985 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC16A1P53985 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC16A1P53985 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC16A1P53985 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC16A1P53985 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC16A1P53985 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC16A1P53985 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC16A1P53985 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC16A1P53985 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC16A1P53985 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC16A1P53985 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC16A1P53985 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC16A1P53985 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC16A1P53985 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC16A1P53985 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC16A1P53985 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC16A1P53985 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC16A1P53985 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC16A1P53985 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC16A1P53985 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC16A1P53985 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC16A1P53985 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms