Protein–RNA interactions for Protein: P52907

CAPZA1, F-actin-capping protein subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA1P52907 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPZA1P52907 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPZA1P52907 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPZA1P52907 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPZA1P52907 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPZA1P52907 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPZA1P52907 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPZA1P52907 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CAPZA1P52907 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPZA1P52907 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPZA1P52907 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPZA1P52907 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPZA1P52907 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPZA1P52907 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPZA1P52907 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPZA1P52907 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPZA1P52907 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPZA1P52907 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPZA1P52907 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPZA1P52907 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPZA1P52907 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPZA1P52907 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPZA1P52907 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPZA1P52907 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPZA1P52907 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPZA1P52907 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPZA1P52907 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPZA1P52907 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPZA1P52907 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CAPZA1P52907 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPZA1P52907 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPZA1P52907 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPZA1P52907 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPZA1P52907 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPZA1P52907 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPZA1P52907 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPZA1P52907 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPZA1P52907 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPZA1P52907 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPZA1P52907 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPZA1P52907 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPZA1P52907 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPZA1P52907 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPZA1P52907 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPZA1P52907 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPZA1P52907 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPZA1P52907 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPZA1P52907 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPZA1P52907 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPZA1P52907 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPZA1P52907 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPZA1P52907 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPZA1P52907 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPZA1P52907 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPZA1P52907 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAPZA1P52907 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPZA1P52907 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPZA1P52907 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPZA1P52907 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPZA1P52907 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPZA1P52907 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPZA1P52907 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPZA1P52907 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPZA1P52907 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPZA1P52907 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPZA1P52907 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPZA1P52907 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPZA1P52907 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPZA1P52907 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPZA1P52907 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPZA1P52907 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPZA1P52907 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPZA1P52907 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPZA1P52907 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPZA1P52907 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPZA1P52907 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPZA1P52907 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPZA1P52907 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPZA1P52907 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPZA1P52907 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPZA1P52907 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPZA1P52907 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPZA1P52907 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPZA1P52907 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPZA1P52907 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPZA1P52907 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPZA1P52907 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPZA1P52907 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPZA1P52907 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPZA1P52907 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPZA1P52907 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPZA1P52907 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPZA1P52907 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPZA1P52907 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPZA1P52907 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPZA1P52907 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPZA1P52907 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPZA1P52907 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPZA1P52907 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPZA1P52907 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms