Protein–RNA interactions for Protein: P51861

CDR1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR1P51861 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDR1P51861 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDR1P51861 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDR1P51861 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDR1P51861 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDR1P51861 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDR1P51861 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDR1P51861 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDR1P51861 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDR1P51861 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDR1P51861 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CDR1P51861 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDR1P51861 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDR1P51861 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDR1P51861 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDR1P51861 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDR1P51861 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDR1P51861 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDR1P51861 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDR1P51861 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDR1P51861 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDR1P51861 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CDR1P51861 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDR1P51861 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDR1P51861 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDR1P51861 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDR1P51861 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDR1P51861 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDR1P51861 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDR1P51861 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDR1P51861 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDR1P51861 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDR1P51861 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDR1P51861 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDR1P51861 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDR1P51861 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDR1P51861 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDR1P51861 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CDR1P51861 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDR1P51861 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDR1P51861 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDR1P51861 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDR1P51861 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDR1P51861 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDR1P51861 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDR1P51861 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDR1P51861 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CDR1P51861 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CDR1P51861 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CDR1P51861 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CDR1P51861 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDR1P51861 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDR1P51861 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDR1P51861 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDR1P51861 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDR1P51861 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDR1P51861 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDR1P51861 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDR1P51861 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDR1P51861 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDR1P51861 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDR1P51861 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CDR1P51861 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDR1P51861 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDR1P51861 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDR1P51861 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDR1P51861 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDR1P51861 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDR1P51861 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDR1P51861 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CDR1P51861 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDR1P51861 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDR1P51861 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CDR1P51861 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDR1P51861 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDR1P51861 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDR1P51861 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDR1P51861 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CDR1P51861 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDR1P51861 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDR1P51861 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDR1P51861 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CDR1P51861 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDR1P51861 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CDR1P51861 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDR1P51861 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDR1P51861 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDR1P51861 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDR1P51861 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDR1P51861 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDR1P51861 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDR1P51861 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDR1P51861 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDR1P51861 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDR1P51861 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDR1P51861 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDR1P51861 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDR1P51861 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDR1P51861 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDR1P51861 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms