Protein–RNA interactions for Protein: P51787

KCNQ1, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 1, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1P51787 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KCNQ1P51787 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KCNQ1P51787 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KCNQ1P51787 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KCNQ1P51787 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KCNQ1P51787 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KCNQ1P51787 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KCNQ1P51787 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KCNQ1P51787 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KCNQ1P51787 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KCNQ1P51787 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KCNQ1P51787 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KCNQ1P51787 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KCNQ1P51787 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNQ1P51787 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNQ1P51787 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNQ1P51787 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNQ1P51787 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNQ1P51787 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNQ1P51787 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNQ1P51787 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNQ1P51787 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNQ1P51787 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNQ1P51787 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNQ1P51787 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNQ1P51787 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNQ1P51787 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KCNQ1P51787 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KCNQ1P51787 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KCNQ1P51787 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
KCNQ1P51787 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KCNQ1P51787 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KCNQ1P51787 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KCNQ1P51787 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KCNQ1P51787 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KCNQ1P51787 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KCNQ1P51787 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KCNQ1P51787 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KCNQ1P51787 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KCNQ1P51787 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KCNQ1P51787 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KCNQ1P51787 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KCNQ1P51787 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KCNQ1P51787 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KCNQ1P51787 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KCNQ1P51787 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KCNQ1P51787 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KCNQ1P51787 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KCNQ1P51787 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KCNQ1P51787 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KCNQ1P51787 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
KCNQ1P51787 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KCNQ1P51787 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KCNQ1P51787 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
KCNQ1P51787 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
KCNQ1P51787 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KCNQ1P51787 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
KCNQ1P51787 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KCNQ1P51787 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KCNQ1P51787 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KCNQ1P51787 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KCNQ1P51787 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
KCNQ1P51787 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KCNQ1P51787 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KCNQ1P51787 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KCNQ1P51787 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KCNQ1P51787 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KCNQ1P51787 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KCNQ1P51787 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KCNQ1P51787 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KCNQ1P51787 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
KCNQ1P51787 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KCNQ1P51787 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
KCNQ1P51787 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
KCNQ1P51787 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KCNQ1P51787 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KCNQ1P51787 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KCNQ1P51787 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KCNQ1P51787 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KCNQ1P51787 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KCNQ1P51787 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KCNQ1P51787 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KCNQ1P51787 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KCNQ1P51787 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KCNQ1P51787 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KCNQ1P51787 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KCNQ1P51787 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KCNQ1P51787 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KCNQ1P51787 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNQ1P51787 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNQ1P51787 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNQ1P51787 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
KCNQ1P51787 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KCNQ1P51787 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KCNQ1P51787 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KCNQ1P51787 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KCNQ1P51787 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KCNQ1P51787 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KCNQ1P51787 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KCNQ1P51787 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms