Protein–RNA interactions for Protein: P49796

RGS3, Regulator of G-protein signaling 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGS3P49796 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RGS3P49796 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RGS3P49796 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
RGS3P49796 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
RGS3P49796 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
RGS3P49796 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
RGS3P49796 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
RGS3P49796 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
RGS3P49796 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
RGS3P49796 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
RGS3P49796 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
RGS3P49796 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
RGS3P49796 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
RGS3P49796 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
RGS3P49796 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC33.06■■■□□ 2.88
RGS3P49796 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
RGS3P49796 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
RGS3P49796 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
RGS3P49796 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
RGS3P49796 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
RGS3P49796 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
RGS3P49796 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
RGS3P49796 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
RGS3P49796 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
RGS3P49796 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
RGS3P49796 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
RGS3P49796 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
RGS3P49796 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
RGS3P49796 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
RGS3P49796 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
RGS3P49796 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC32.99■■■□□ 2.87
RGS3P49796 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
RGS3P49796 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
RGS3P49796 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
RGS3P49796 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
RGS3P49796 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
RGS3P49796 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
RGS3P49796 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
RGS3P49796 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
RGS3P49796 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
RGS3P49796 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
RGS3P49796 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
RGS3P49796 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
RGS3P49796 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
RGS3P49796 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
RGS3P49796 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
RGS3P49796 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
RGS3P49796 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
RGS3P49796 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
RGS3P49796 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
RGS3P49796 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
RGS3P49796 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
RGS3P49796 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
RGS3P49796 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
RGS3P49796 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
RGS3P49796 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
RGS3P49796 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
RGS3P49796 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
RGS3P49796 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
RGS3P49796 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC32.89■■■□□ 2.86
RGS3P49796 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
RGS3P49796 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
RGS3P49796 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
RGS3P49796 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
RGS3P49796 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
RGS3P49796 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
RGS3P49796 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
RGS3P49796 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
RGS3P49796 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
RGS3P49796 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
RGS3P49796 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
RGS3P49796 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
RGS3P49796 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
RGS3P49796 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
RGS3P49796 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
RGS3P49796 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
RGS3P49796 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
RGS3P49796 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
RGS3P49796 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
RGS3P49796 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
RGS3P49796 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
RGS3P49796 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
RGS3P49796 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
RGS3P49796 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
RGS3P49796 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
RGS3P49796 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
RGS3P49796 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
RGS3P49796 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
RGS3P49796 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
RGS3P49796 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
RGS3P49796 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
RGS3P49796 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
RGS3P49796 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
RGS3P49796 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
RGS3P49796 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
RGS3P49796 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
RGS3P49796 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
RGS3P49796 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
RGS3P49796 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
RGS3P49796 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms