Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPAP49450 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPAP49450 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPAP49450 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPAP49450 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPAP49450 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPAP49450 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPAP49450 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPAP49450 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPAP49450 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPAP49450 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPAP49450 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPAP49450 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPAP49450 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPAP49450 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPAP49450 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPAP49450 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CENPAP49450 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPAP49450 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPAP49450 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPAP49450 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPAP49450 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPAP49450 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPAP49450 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPAP49450 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPAP49450 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPAP49450 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPAP49450 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPAP49450 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPAP49450 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CENPAP49450 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPAP49450 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPAP49450 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPAP49450 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPAP49450 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPAP49450 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPAP49450 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPAP49450 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPAP49450 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPAP49450 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPAP49450 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPAP49450 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPAP49450 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPAP49450 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPAP49450 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPAP49450 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPAP49450 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPAP49450 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPAP49450 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPAP49450 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPAP49450 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CENPAP49450 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPAP49450 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPAP49450 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPAP49450 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPAP49450 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPAP49450 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPAP49450 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPAP49450 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPAP49450 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPAP49450 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPAP49450 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPAP49450 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPAP49450 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPAP49450 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPAP49450 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPAP49450 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPAP49450 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPAP49450 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPAP49450 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPAP49450 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPAP49450 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPAP49450 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPAP49450 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPAP49450 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CENPAP49450 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPAP49450 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPAP49450 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPAP49450 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPAP49450 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPAP49450 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPAP49450 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPAP49450 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPAP49450 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPAP49450 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPAP49450 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPAP49450 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPAP49450 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPAP49450 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPAP49450 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPAP49450 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPAP49450 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPAP49450 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPAP49450 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPAP49450 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPAP49450 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPAP49450 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPAP49450 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPAP49450 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPAP49450 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms