Protein–RNA interactions for Protein: P47976

CTH1, mRNA decay factor CTH1, yeastyeast

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTH1P47976 TRT2tT(CGU)K 72 nt10.99□□□□□ -0.65
CTH1P47976 TMA23YMR269W 636 nt10.98□□□□□ -0.65
CTH1P47976 FUB1YCR076C 753 nt10.96□□□□□ -0.65
CTH1P47976 SPS100YHR139C 981 nt10.96□□□□□ -0.65
CTH1P47976 ADH3YMR083W 1128 nt10.96□□□□□ -0.65
CTH1P47976 EDC2YER035W 438 nt10.95□□□□□ -0.66
CTH1P47976 DDI1YER143W 1287 nt10.95□□□□□ -0.66
CTH1P47976 PHB2YGR231C 933 nt10.94□□□□□ -0.66
CTH1P47976 SPE2YOL052C 1191 nt10.94□□□□□ -0.66
CTH1P47976 YPL247CYPL247C 1572 nt10.92□□□□□ -0.66
CTH1P47976 TGA1tA(UGC)A 73 nt10.92□□□□□ -0.66
CTH1P47976 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt10.92□□□□□ -0.66
CTH1P47976 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt10.92□□□□□ -0.66
CTH1P47976 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt10.92□□□□□ -0.66
CTH1P47976 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt10.92□□□□□ -0.66
CTH1P47976 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt10.92□□□□□ -0.66
CTH1P47976 HSL7YBR133C 2484 nt10.92□□□□□ -0.66
CTH1P47976 SEC61YLR378C 1443 nt10.92□□□□□ -0.66
CTH1P47976 THP3YPR045C 1413 nt10.91□□□□□ -0.66
CTH1P47976 SAM2YDR502C 1155 nt10.9□□□□□ -0.66
CTH1P47976 YER188WYER188W 720 nt10.9□□□□□ -0.66
CTH1P47976 HTS1YPR033C 1641 nt10.89□□□□□ -0.67
CTH1P47976 UFO1YML088W 2007 nt10.89□□□□□ -0.67
CTH1P47976 RSC8YFR037C 1674 nt10.89□□□□□ -0.67
CTH1P47976 RPC82YPR190C 1965 nt10.88□□□□□ -0.67
CTH1P47976 MOB1YIL106W 945 nt10.88□□□□□ -0.67
CTH1P47976 FCY1YPR062W 477 nt10.88□□□□□ -0.67
CTH1P47976 IMO32YGR031W 1029 nt10.87□□□□□ -0.67
CTH1P47976 SDH8YBR269C 417 nt10.87□□□□□ -0.67
CTH1P47976 LSM5YER146W 282 nt10.85□□□□□ -0.67
CTH1P47976 OXA1YER154W 1209 nt10.85□□□□□ -0.67
CTH1P47976 CYC3YAL039C 810 nt10.85□□□□□ -0.67
CTH1P47976 SPT20YOL148C 1815 nt10.84□□□□□ -0.67
CTH1P47976 EMC3YKL207W 762 nt10.84□□□□□ -0.67
CTH1P47976 BET2YPR176C 978 nt10.82□□□□□ -0.68
CTH1P47976 BAP3YDR046C 1815 nt10.81□□□□□ -0.68
CTH1P47976 INA1YLR413W 2028 nt10.81□□□□□ -0.68
CTH1P47976 SHY1YGR112W 1170 nt10.81□□□□□ -0.68
CTH1P47976 ABZ2YMR289W 1125 nt10.8□□□□□ -0.68
CTH1P47976 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt10.79□□□□□ -0.68
CTH1P47976 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt10.79□□□□□ -0.68
CTH1P47976 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt10.79□□□□□ -0.68
CTH1P47976 SUP51tL(UAA)J 84 nt10.79□□□□□ -0.68
CTH1P47976 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt10.79□□□□□ -0.68
CTH1P47976 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt10.79□□□□□ -0.68
CTH1P47976 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt10.79□□□□□ -0.68
CTH1P47976 YGR210CYGR210C 1236 nt10.79□□□□□ -0.68
CTH1P47976 PRE5YMR314W 705 nt10.79□□□□□ -0.68
CTH1P47976 MRP1YDR347W 966 nt10.78□□□□□ -0.68
CTH1P47976 RDN25-1RDN25-1 3396 nt10.76□□□□□ -0.69
CTH1P47976 RDN25-2RDN25-2 3396 nt10.76□□□□□ -0.69
CTH1P47976 DLD2YDL178W 1593 nt10.75□□□□□ -0.69
CTH1P47976 FLR1YBR008C 1647 nt10.74□□□□□ -0.69
CTH1P47976 SOL2YCR073W-A 948 nt10.74□□□□□ -0.69
CTH1P47976 FSH2YMR222C 672 nt10.73□□□□□ -0.69
CTH1P47976 ZRT3YKL175W 1512 nt10.73□□□□□ -0.69
CTH1P47976 OSH7YHR001W 1314 nt10.72□□□□□ -0.69
CTH1P47976 ADE8YDR408C 645 nt10.71□□□□□ -0.69
CTH1P47976 YDR455CYDR455C 309 nt10.71□□□□□ -0.69
CTH1P47976 YJL160CYJL160C 864 nt10.71□□□□□ -0.69
CTH1P47976 YMR210WYMR210W 1350 nt10.69□□□□□ -0.7
CTH1P47976 YJL067WYJL067W 351 nt10.69□□□□□ -0.7
CTH1P47976 URA6YKL024C 615 nt10.69□□□□□ -0.7
CTH1P47976 ERO1YML130C 1692 nt10.69□□□□□ -0.7
CTH1P47976 YKR012CYKR012C 378 nt10.68□□□□□ -0.7
CTH1P47976 TVP23YDR084C 600 nt10.67□□□□□ -0.7
CTH1P47976 TPC1YGR096W 945 nt10.66□□□□□ -0.7
CTH1P47976 PET8YNL003C 855 nt10.66□□□□□ -0.7
CTH1P47976 TAT2YOL020W 1779 nt10.65□□□□□ -0.71
CTH1P47976 YLR280CYLR280C 351 nt10.64□□□□□ -0.71
CTH1P47976 DIG1YPL049C 1359 nt10.64□□□□□ -0.71
CTH1P47976 SRP102YKL154W 735 nt10.63□□□□□ -0.71
CTH1P47976 RRT8YOL048C 1029 nt10.63□□□□□ -0.71
CTH1P47976 HEM13YDR044W 987 nt10.62□□□□□ -0.71
CTH1P47976 YPL108WYPL108W 507 nt10.62□□□□□ -0.71
CTH1P47976 GDH1YOR375C 1365 nt10.62□□□□□ -0.71
CTH1P47976 ENO2YHR174W 1314 nt10.6□□□□□ -0.71
CTH1P47976 YPS3YLR121C 1527 nt10.59□□□□□ -0.71
CTH1P47976 OPI3YJR073C 621 nt10.58□□□□□ -0.72
CTH1P47976 MUP1YGR055W 1725 nt10.57□□□□□ -0.72
CTH1P47976 SDS24YBR214W 1584 nt10.56□□□□□ -0.72
CTH1P47976 ERG13YML126C 1476 nt10.56□□□□□ -0.72
CTH1P47976 FMS1YMR020W 1527 nt10.56□□□□□ -0.72
CTH1P47976 ENO1YGR254W 1314 nt10.55□□□□□ -0.72
CTH1P47976 HOL1YNR055C 1761 nt10.54□□□□□ -0.72
CTH1P47976 ADA2YDR448W 1305 nt10.53□□□□□ -0.72
CTH1P47976 UTR5YEL035C 501 nt10.52□□□□□ -0.73
CTH1P47976 ASP3-1YLR155C 1089 nt10.52□□□□□ -0.73
CTH1P47976 ASP3-2YLR157C 1089 nt10.52□□□□□ -0.73
CTH1P47976 ASP3-3YLR158C 1089 nt10.52□□□□□ -0.73
CTH1P47976 ASP3-4YLR160C 1089 nt10.52□□□□□ -0.73
CTH1P47976 COS10YNR075W 1125 nt10.52□□□□□ -0.73
CTH1P47976 PET18YCR020C 648 nt10.51□□□□□ -0.73
CTH1P47976 AMF1YOR378W 1548 nt10.51□□□□□ -0.73
CTH1P47976 RIM8YGL045W 1629 nt10.5□□□□□ -0.73
CTH1P47976 YOR325WYOR325W 474 nt10.49□□□□□ -0.73
CTH1P47976 RIM2YBR192W 1134 nt10.49□□□□□ -0.73
CTH1P47976 VBA3YCL069W 1377 nt10.48□□□□□ -0.73
CTH1P47976 YJR149WYJR149W 1215 nt10.47□□□□□ -0.73
CTH1P47976 SPP2YOR148C 558 nt10.47□□□□□ -0.73
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