Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL35P42766 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL35P42766 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL35P42766 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPL35P42766 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPL35P42766 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPL35P42766 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPL35P42766 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPL35P42766 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPL35P42766 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPL35P42766 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPL35P42766 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RPL35P42766 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPL35P42766 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPL35P42766 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL35P42766 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL35P42766 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL35P42766 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL35P42766 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL35P42766 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL35P42766 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL35P42766 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL35P42766 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL35P42766 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL35P42766 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL35P42766 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL35P42766 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL35P42766 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL35P42766 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL35P42766 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL35P42766 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL35P42766 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL35P42766 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL35P42766 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL35P42766 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL35P42766 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL35P42766 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL35P42766 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
RPL35P42766 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPL35P42766 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPL35P42766 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPL35P42766 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPL35P42766 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPL35P42766 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPL35P42766 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPL35P42766 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPL35P42766 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPL35P42766 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL35P42766 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL35P42766 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL35P42766 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL35P42766 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL35P42766 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL35P42766 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL35P42766 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL35P42766 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL35P42766 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL35P42766 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL35P42766 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPL35P42766 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPL35P42766 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPL35P42766 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPL35P42766 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPL35P42766 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPL35P42766 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPL35P42766 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPL35P42766 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPL35P42766 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPL35P42766 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPL35P42766 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPL35P42766 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPL35P42766 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPL35P42766 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPL35P42766 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPL35P42766 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPL35P42766 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPL35P42766 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPL35P42766 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPL35P42766 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPL35P42766 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPL35P42766 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPL35P42766 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPL35P42766 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPL35P42766 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPL35P42766 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPL35P42766 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPL35P42766 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPL35P42766 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPL35P42766 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPL35P42766 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPL35P42766 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPL35P42766 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPL35P42766 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPL35P42766 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPL35P42766 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPL35P42766 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPL35P42766 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RPL35P42766 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPL35P42766 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPL35P42766 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms