Protein–RNA interactions for Protein: P39548

YAR028W, DUP240 protein YAR028W, yeastyeast

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YAR028WP39548 YHR218WYHR218W 1812 nt8.47□□□□□ -1.05
YAR028WP39548 DLD3YEL071W 1491 nt8.46□□□□□ -1.05
YAR028WP39548 SOL2YCR073W-A 948 nt8.46□□□□□ -1.06
YAR028WP39548 YLR046CYLR046C 813 nt8.46□□□□□ -1.06
YAR028WP39548 AST1YBL069W 1290 nt8.46□□□□□ -1.06
YAR028WP39548 YNL165WYNL165W 1221 nt8.46□□□□□ -1.06
YAR028WP39548 YHL008CYHL008C 1884 nt8.45□□□□□ -1.06
YAR028WP39548 MDM35YKL053C-A 261 nt8.45□□□□□ -1.06
YAR028WP39548 GPN2YOR262W 1044 nt8.45□□□□□ -1.06
YAR028WP39548 ASP3-1YLR155C 1089 nt8.44□□□□□ -1.06
YAR028WP39548 ASP3-2YLR157C 1089 nt8.44□□□□□ -1.06
YAR028WP39548 ASP3-3YLR158C 1089 nt8.44□□□□□ -1.06
YAR028WP39548 ASP3-4YLR160C 1089 nt8.44□□□□□ -1.06
YAR028WP39548 GND1YHR183W 1470 nt8.44□□□□□ -1.06
YAR028WP39548 YJL107CYJL107C 1164 nt8.43□□□□□ -1.06
YAR028WP39548 SMM1YNR015W 1155 nt8.43□□□□□ -1.06
YAR028WP39548 PET20YPL159C 762 nt8.43□□□□□ -1.06
YAR028WP39548 LSB5YCL034W 1065 nt8.43□□□□□ -1.06
YAR028WP39548 YRF1-2YER190W 5046 nt8.43□□□□□ -1.06
YAR028WP39548 Q0144Q0144 330 nt8.42□□□□□ -1.06
YAR028WP39548 LSR1LSR1 1175 nt8.42□□□□□ -1.06
YAR028WP39548 HOS2YGL194C 1359 nt8.42□□□□□ -1.06
YAR028WP39548 SAM3YPL274W 1764 nt8.42□□□□□ -1.06
YAR028WP39548 RPD3YNL330C 1302 nt8.41□□□□□ -1.06
YAR028WP39548 snR78snR78 87 nt8.41□□□□□ -1.06
YAR028WP39548 RIB3YDR487C 627 nt8.4□□□□□ -1.06
YAR028WP39548 EAF3YPR023C 1206 nt8.4□□□□□ -1.06
YAR028WP39548 MET2YNL277W 1461 nt8.39□□□□□ -1.07
YAR028WP39548 THP3YPR045C 1413 nt8.39□□□□□ -1.07
YAR028WP39548 RPT5YOR117W 1305 nt8.39□□□□□ -1.07
YAR028WP39548 CAB5YDR196C 726 nt8.39□□□□□ -1.07
YAR028WP39548 YDR455CYDR455C 309 nt8.39□□□□□ -1.07
YAR028WP39548 YNR068CYNR068C 819 nt8.39□□□□□ -1.07
YAR028WP39548 BSP1YPR171W 1731 nt8.39□□□□□ -1.07
YAR028WP39548 EEB1YPL095C 1371 nt8.38□□□□□ -1.07
YAR028WP39548 OYE2YHR179W 1203 nt8.38□□□□□ -1.07
YAR028WP39548 TIM44YIL022W 1296 nt8.38□□□□□ -1.07
YAR028WP39548 ITR2YOL103W 1830 nt8.38□□□□□ -1.07
YAR028WP39548 HXT10YFL011W 1641 nt8.37□□□□□ -1.07
YAR028WP39548 YJL211CYJL211C 444 nt8.37□□□□□ -1.07
YAR028WP39548 NPP1YCR026C 2229 nt8.36□□□□□ -1.07
YAR028WP39548 YDR509WYDR509W 348 nt8.36□□□□□ -1.07
YAR028WP39548 RMA1YKL132C 1293 nt8.36□□□□□ -1.07
YAR028WP39548 YLR111WYLR111W 333 nt8.36□□□□□ -1.07
YAR028WP39548 SFP1YLR403W 2052 nt8.36□□□□□ -1.07
YAR028WP39548 VMA11YPL234C 495 nt8.35□□□□□ -1.07
YAR028WP39548 RSM23YGL129C 1353 nt8.35□□□□□ -1.07
YAR028WP39548 LOT5YKL183W 921 nt8.34□□□□□ -1.07
YAR028WP39548 YMR262WYMR262W 942 nt8.34□□□□□ -1.07
YAR028WP39548 TPS1YBR126C 1488 nt8.33□□□□□ -1.08
YAR028WP39548 YDR306CYDR306C 1437 nt8.33□□□□□ -1.08
YAR028WP39548 LSM5YER146W 282 nt8.33□□□□□ -1.08
YAR028WP39548 ERG13YML126C 1476 nt8.32□□□□□ -1.08
YAR028WP39548 APM1YPL259C 1428 nt8.32□□□□□ -1.08
YAR028WP39548 COX16YJL003W 357 nt8.32□□□□□ -1.08
YAR028WP39548 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt8.31□□□□□ -1.08
YAR028WP39548 YMR147WYMR147W 672 nt8.31□□□□□ -1.08
YAR028WP39548 SCO2YBR024W 906 nt8.31□□□□□ -1.08
YAR028WP39548 TIP1YBR067C 633 nt8.31□□□□□ -1.08
YAR028WP39548 HXT12YIL170W 1374 nt8.31□□□□□ -1.08
YAR028WP39548 YGL118CYGL118C 438 nt8.3□□□□□ -1.08
YAR028WP39548 YJL055WYJL055W 738 nt8.3□□□□□ -1.08
YAR028WP39548 RPC31YNL151C 756 nt8.3□□□□□ -1.08
YAR028WP39548 LSB3YFR024C-A 1380 nt8.3□□□□□ -1.08
YAR028WP39548 GLR1YPL091W 1452 nt8.3□□□□□ -1.08
YAR028WP39548 KRR1YCL059C 951 nt8.29□□□□□ -1.08
YAR028WP39548 PIC2YER053C 903 nt8.29□□□□□ -1.08
YAR028WP39548 DDI1YER143W 1287 nt8.29□□□□□ -1.08
YAR028WP39548 URE2YNL229C 1065 nt8.29□□□□□ -1.08
YAR028WP39548 RIM2YBR192W 1134 nt8.29□□□□□ -1.08
YAR028WP39548 AGP3YFL055W 1677 nt8.29□□□□□ -1.08
YAR028WP39548 SAC7YDR389W 1965 nt8.29□□□□□ -1.08
YAR028WP39548 VRG4YGL225W 1014 nt8.28□□□□□ -1.08
YAR028WP39548 IDP3YNL009W 1263 nt8.28□□□□□ -1.08
YAR028WP39548 SNX3YOR357C 489 nt8.28□□□□□ -1.08
YAR028WP39548 PUS7YOR243C 2031 nt8.27□□□□□ -1.09
YAR028WP39548 TMA23YMR269W 636 nt8.27□□□□□ -1.09
YAR028WP39548 ESBP6YNL125C 2022 nt8.27□□□□□ -1.09
YAR028WP39548 RRT8YOL048C 1029 nt8.26□□□□□ -1.09
YAR028WP39548 NAT5YOR253W 531 nt8.26□□□□□ -1.09
YAR028WP39548 RIB7YBR153W 735 nt8.26□□□□□ -1.09
YAR028WP39548 ATG22YCL038C 1587 nt8.26□□□□□ -1.09
YAR028WP39548 DPL1YDR294C 1770 nt8.25□□□□□ -1.09
YAR028WP39548 GAL3YDR009W 1563 nt8.24□□□□□ -1.09
YAR028WP39548 YMR226CYMR226C 804 nt8.24□□□□□ -1.09
YAR028WP39548 PZF1YPR186C 1290 nt8.23□□□□□ -1.09
YAR028WP39548 ICE2YIL090W 1476 nt8.23□□□□□ -1.09
YAR028WP39548 TPO4YOR273C 1980 nt8.22□□□□□ -1.09
YAR028WP39548 YEL074WYEL074W 339 nt8.22□□□□□ -1.09
YAR028WP39548 IMO32YGR031W 1029 nt8.22□□□□□ -1.09
YAR028WP39548 YBL081WYBL081W 1107 nt8.22□□□□□ -1.09
YAR028WP39548 MOD5YOR274W 1287 nt8.22□□□□□ -1.09
YAR028WP39548 NBA1YOL070C 1506 nt8.21□□□□□ -1.1
YAR028WP39548 INH1YDL181W 258 nt8.21□□□□□ -1.1
YAR028WP39548 PCP1YGR101W 1041 nt8.21□□□□□ -1.1
YAR028WP39548 YMR265CYMR265C 1386 nt8.21□□□□□ -1.1
YAR028WP39548 HMG2YLR450W 3138 nt8.2□□□□□ -1.1
YAR028WP39548 HXK1YFR053C 1458 nt8.2□□□□□ -1.1
YAR028WP39548 ALD5YER073W 1563 nt8.2□□□□□ -1.1
YAR028WP39548 YCR099CYCR099C 468 nt8.2□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.2 ms