Protein–RNA interactions for Protein: P38871

SSP1, Sporulation-specific protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSP1P38871 SPG5YMR191W 1122 nt11.66□□□□□ -0.54
SSP1P38871 YAP7YOL028C 738 nt11.66□□□□□ -0.54
SSP1P38871 DIT1YDR403W 1611 nt11.66□□□□□ -0.54
SSP1P38871 snR57snR57 88 nt11.65□□□□□ -0.54
SSP1P38871 DIC1YLR348C 897 nt11.65□□□□□ -0.54
SSP1P38871 HEM15YOR176W 1182 nt11.65□□□□□ -0.54
SSP1P38871 PGC1YPL206C 966 nt11.65□□□□□ -0.54
SSP1P38871 YKR015CYKR015C 1707 nt11.65□□□□□ -0.54
SSP1P38871 OKP1YGR179C 1221 nt11.64□□□□□ -0.55
SSP1P38871 SPT8YLR055C 1809 nt11.64□□□□□ -0.55
SSP1P38871 OCA4YCR095C 1089 nt11.63□□□□□ -0.55
SSP1P38871 UBX6YJL048C 1191 nt11.63□□□□□ -0.55
SSP1P38871 VPS20YMR077C 666 nt11.63□□□□□ -0.55
SSP1P38871 YIF1YNL263C 945 nt11.63□□□□□ -0.55
SSP1P38871 ATG29YPL166W 642 nt11.63□□□□□ -0.55
SSP1P38871 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt11.62□□□□□ -0.55
SSP1P38871 PCD1YLR151C 1023 nt11.62□□□□□ -0.55
SSP1P38871 CTR3YLR411W 726 nt11.62□□□□□ -0.55
SSP1P38871 TIM23YNR017W 669 nt11.62□□□□□ -0.55
SSP1P38871 BAG7YOR134W 1230 nt11.62□□□□□ -0.55
SSP1P38871 IPI3YNL182C 1668 nt11.62□□□□□ -0.55
SSP1P38871 TCA17YEL048C 459 nt11.61□□□□□ -0.55
SSP1P38871 SEC28YIL076W 891 nt11.61□□□□□ -0.55
SSP1P38871 CDA2YLR308W 939 nt11.61□□□□□ -0.55
SSP1P38871 YOL024WYOL024W 519 nt11.61□□□□□ -0.55
SSP1P38871 SSN3YPL042C 1668 nt11.61□□□□□ -0.55
SSP1P38871 GCV1YDR019C 1203 nt11.6□□□□□ -0.55
SSP1P38871 BMT6YLR063W 1098 nt11.6□□□□□ -0.55
SSP1P38871 MCM5YLR274W 2328 nt11.59□□□□□ -0.55
SSP1P38871 YIH1YCR059C 777 nt11.59□□□□□ -0.55
SSP1P38871 YKR075CYKR075C 924 nt11.59□□□□□ -0.55
SSP1P38871 SLD7YOR060C 774 nt11.59□□□□□ -0.55
SSP1P38871 HMRA1YCR097W 381 nt11.58□□□□□ -0.56
SSP1P38871 POP4YBR257W 840 nt11.58□□□□□ -0.56
SSP1P38871 KAR1YNL188W 1302 nt11.57□□□□□ -0.56
SSP1P38871 UME6YDR207C 2511 nt11.56□□□□□ -0.56
SSP1P38871 YDL241WYDL241W 372 nt11.56□□□□□ -0.56
SSP1P38871 YDR094WYDR094W 336 nt11.56□□□□□ -0.56
SSP1P38871 YDR161WYDR161W 1164 nt11.56□□□□□ -0.56
SSP1P38871 YGR066CYGR066C 879 nt11.56□□□□□ -0.56
SSP1P38871 MLS1YNL117W 1665 nt11.55□□□□□ -0.56
SSP1P38871 ARO9YHR137W 1542 nt11.55□□□□□ -0.56
SSP1P38871 CDC10YCR002C 969 nt11.55□□□□□ -0.56
SSP1P38871 MAK32YCR019W 1092 nt11.55□□□□□ -0.56
SSP1P38871 YDL129WYDL129W 876 nt11.55□□□□□ -0.56
SSP1P38871 YLR179CYLR179C 606 nt11.55□□□□□ -0.56
SSP1P38871 RTN1YDR233C 888 nt11.54□□□□□ -0.56
SSP1P38871 ATP12YJL180C 978 nt11.54□□□□□ -0.56
SSP1P38871 UBC5YDR059C 447 nt11.53□□□□□ -0.56
SSP1P38871 ERF2YLR246W 1080 nt11.53□□□□□ -0.56
SSP1P38871 WHI4YDL224C 1950 nt11.52□□□□□ -0.56
SSP1P38871 YLL053CYLL053C 459 nt11.52□□□□□ -0.57
SSP1P38871 YIP3YNL044W 531 nt11.52□□□□□ -0.57
SSP1P38871 RAD17YOR368W 1206 nt11.52□□□□□ -0.57
SSP1P38871 ATG23YLR431C 1362 nt11.52□□□□□ -0.57
SSP1P38871 SEN2YLR105C 1134 nt11.51□□□□□ -0.57
SSP1P38871 VTA1YLR181C 993 nt11.51□□□□□ -0.57
SSP1P38871 CRR1YLR213C 1269 nt11.51□□□□□ -0.57
SSP1P38871 CSL4YNL232W 879 nt11.51□□□□□ -0.57
SSP1P38871 PTC4YBR125C 1182 nt11.51□□□□□ -0.57
SSP1P38871 ECM2YBR065C 1095 nt11.5□□□□□ -0.57
SSP1P38871 YPR064WYPR064W 420 nt11.5□□□□□ -0.57
SSP1P38871 TSC10YBR265W 963 nt11.5□□□□□ -0.57
SSP1P38871 GPI18YBR004C 1302 nt11.5□□□□□ -0.57
SSP1P38871 SHE9YDR393W 1371 nt11.5□□□□□ -0.57
SSP1P38871 RPC53YDL150W 1269 nt11.49□□□□□ -0.57
SSP1P38871 RBG2YGR173W 1107 nt11.49□□□□□ -0.57
SSP1P38871 POP5YAL033W 522 nt11.49□□□□□ -0.57
SSP1P38871 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt11.49□□□□□ -0.57
SSP1P38871 YPL068CYPL068C 882 nt11.49□□□□□ -0.57
SSP1P38871 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.48□□□□□ -0.57
SSP1P38871 SNF7YLR025W 723 nt11.48□□□□□ -0.57
SSP1P38871 YNL226WYNL226W 411 nt11.48□□□□□ -0.57
SSP1P38871 BRL1YHR036W 1416 nt11.48□□□□□ -0.57
SSP1P38871 CBK1YNL161W 2271 nt11.48□□□□□ -0.57
SSP1P38871 MUM3YOR298W 1440 nt11.47□□□□□ -0.57
SSP1P38871 ARL3YPL051W 597 nt11.47□□□□□ -0.57
SSP1P38871 SWE1YJL187C 2460 nt11.47□□□□□ -0.57
SSP1P38871 YDR029WYDR029W 315 nt11.46□□□□□ -0.57
SSP1P38871 MTG1YMR097C 1104 nt11.46□□□□□ -0.57
SSP1P38871 GLC8YMR311C 690 nt11.46□□□□□ -0.57
SSP1P38871 HHO1YPL127C 777 nt11.46□□□□□ -0.57
SSP1P38871 YDR541CYDR541C 1035 nt11.45□□□□□ -0.58
SSP1P38871 ARG3YJL088W 1017 nt11.45□□□□□ -0.58
SSP1P38871 YBR089WYBR089W 600 nt11.45□□□□□ -0.58
SSP1P38871 HDA1YNL021W 2121 nt11.45□□□□□ -0.58
SSP1P38871 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.44□□□□□ -0.58
SSP1P38871 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.44□□□□□ -0.58
SSP1P38871 TRP1YDR007W 675 nt11.44□□□□□ -0.58
SSP1P38871 ORM1YGR038W 669 nt11.44□□□□□ -0.58
SSP1P38871 SSU72YNL222W 621 nt11.44□□□□□ -0.58
SSP1P38871 HER2YMR293C 1395 nt11.43□□□□□ -0.58
SSP1P38871 ATF2YGR177C 1608 nt11.43□□□□□ -0.58
SSP1P38871 TVP23YDR084C 600 nt11.43□□□□□ -0.58
SSP1P38871 MIR1YJR077C 936 nt11.43□□□□□ -0.58
SSP1P38871 NCE102YPR149W 522 nt11.43□□□□□ -0.58
SSP1P38871 YDL121CYDL121C 450 nt11.42□□□□□ -0.58
SSP1P38871 AVO2YMR068W 1281 nt11.42□□□□□ -0.58
SSP1P38871 ATG19YOL082W 1248 nt11.42□□□□□ -0.58
SSP1P38871 CMK1YFR014C 1341 nt11.41□□□□□ -0.58
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